科研图片的重要性是非常重要的,审稿人看到一个低质量的或者欠美观的图片,很可能影响文章的审稿。本期我将介绍一种画功能连接矩阵热力图的程序。该程序使用简单,有了改代码再也不用担心类似下图的矩阵热力图。
以下几幅图都是来自一些神经、精神、心理学的顶级期刊,包括nature medicine,nature communications、brain等。这些图是以矩热力图的形式展示的功能连接或者统计学结果图。我们可以看到属于不同的网络的节点的连接被一些网格线分割开,很容易让别人识别脑网络。
以下图片是使用笔者改程序做出来的矩阵热力图,这个图反映的是sub001的功能连接。
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进入具体操作正题: 第1步,下载代码和例子数据:代码下载地址(进入github项目后可以下载我的整个项目,也可以只下载该代码,最简单的方式就是直接把代码复制到matlab新建的函数里面):https://github.com/lichao312214129/lc_rsfmri_tools_matlab/blob/master/Workstation/code_workstation2018_dynamicFC/visualization/lc_netplot.m数据下载地址(将其中的netIndex.mat和sub001.mat下载下来): https://github.com/lichao312214129/lc_rsfmri_tools_matlab/tree/master/Workstation/code_workstation2018_dynamicFC/visualization/toy_data 第2步,整理下载的文件:将下载的两个.mat文件(netIndex.mat 和sub001.mat)放在一个叫做toy_data的文件夹下。并将下载的代码(lc_netplot.m)放在与toy_data同级的文件下。 第3步,运行代码:代码setpath到matlab路径后,在matlab命令窗口输入”lc_netplot”后,程序会在窗口打印出两个使用的例子,分别是EXAMPLE1和EXAMPLE 2.复制其中一个例子,到窗口,回车即可运行代码。运行结束后,图片会保存到toy_data文件夹下。注:代码使用非常简单,另外代码里面有详细的使用信息,大家可以自行修改。该代码使用brewermap来生成网络legends的colormap。代码作者黎超,如有使用问题欢迎咨询。邮箱:lichao19870617@163.com或者lichao19870617@gmail.com科研服务
第一届fMRI动态指标/功能连接专题班(郑州,2020.8.28—8.31) 第一届磁共振数据分析技术基础班(西安,2020.9.25-9.29) 第二届脑电数据分析技术实战班(郑州,2020.8.15—8.20) 脑电数据处理和机器学习分析服务 fMRI数据处理服务 脑影像数据MVPA和机器学习分析服务 结构MRI数据处理服务 关注我们![ce43fc23b50567d9e7a07297f421c3e5.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/646944d548c7a35c0fc282f00a340ff9.jpeg)