linux根据列提取全行的内容,linux提取指定列字符并打印所有内容(awk)

本文介绍了如何使用awk命令从包含多列的数据文件中,根据第一列的特定字符(这里是'3')筛选并打印完整行。通过示例展示了如何将符合条件的行输出到新的文件中。
摘要由CSDN通过智能技术生成

假设有文件长如下样子:

CHROM  POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  samplename

1 3552841 . G . 32.995 . DP=1;MQ0F=0;AF1=0;AC1=0;DP4=1,0,0,0;MQ=40;FQ=-29.9912 GT:PL:DP 0/0:0:1

1 3552842 . T . 32.995 . DP=1;MQ0F=0;AF1=0;AC1=0;DP4=1,0,0,0;MQ=40;FQ=-29.9912 GT:PL:DP 0/0:0:1

2 3552843 . G . 32.995 . DP=1;MQ0F=0;AF1=0;AC1=0;DP4=1,0,0,0;MQ=40;FQ=-29.9912 GT:PL:DP 0/0:0:1

2 3552844 . T . 32.995 . DP=1;MQ0F=0;AF1=0;AC1=0;DP4=1,0,0,0;MQ=40;FQ=-29.9912 GT:PL:DP 0/0:0:1

3 3552845 . G . 32.995 . DP=1;MQ0F=0;AF1=0;AC1=0;DP4=1,0,0,0;MQ=40;FQ=-29.9912 GT:PL:DP 0/0:0:1

3 3552846 . C . 32.995 . DP=1;MQ0F=0;AF1=0;AC1=0;DP4=1,0,0,0;MQ=40;FQ=-29.9912 GT:PL:DP 0/0:0:1

4 3552847 . A . 32.995 . DP=1;MQ0F=0;AF1

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