r语言进行go富集分析_GO富集分析可视化：R语言GOplot包

找R语言做弦图的教程的时候发现了这个包：GOplot。其主要功能是可视化GO富集分析的结果。自己应该会用得到。 第一步是学习其帮助文档中的例子，然后学习如何准备自己的数据，并利用这个包中的函数来绘图

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library(GOplot)

help(package="GOplot")

重复帮助文档中的教程

data(EC)

class(EC)

dim(EC$david)

dim(EC$genelist)

circ

class(circ)

head(circ)

category ID term count genes

1 BP GO:0007507 heart development 54 DLC1

2 BP GO:0007507 heart development 54 NRP2

3 BP GO:0007507 heart development 54 NRP1

4 BP GO:0007507 heart development 54 EDN1

5 BP GO:0007507 heart development 54 PDLIM3

6 BP GO:0007507 heart development 54 GJA1

logFC adj_pval zscore

1 -0.9707875 2.17e-06 -0.8164966

2 -1.5153173 2.17e-06 -0.8164966

3 -1.1412315 2.17e-06 -0.8164966

4 1.3813006 2.17e-06 -0.8164966

5 -0.8876939 2.17e-06 -0.8164966

6 -