linux下载r安装包下载地址,在linux上安装R包的5种方法

本文详细介绍了在Linux系统中安装R包的五种方法:1) 使用R内置函数install.packages();2) 直接从包主页下载;3) 下载后本地安装;4) 命令行版本安装;5) 通过Anaconda安装。针对不同情况,如网络问题、版本限制和依赖关系,提供了相应的解决方案。
摘要由CSDN通过智能技术生成

第一种方式,当然是R自带的函数直接安装包了,这个是最简单的,而且不需要考虑各种包之间的依赖关系。

对普通的R包,直接install.packages()即可,一般下载不了都是包的名字打错了,或者是R的版本不够,如果下载了安装不了,一般是依赖包没弄好,或者你的电脑缺少一些库文件,如果实在是找不到或者下载慢,一般就用repos=来切换一些镜像。

install.packages("ape") ##直接输入包名字即可

对于bioconductor的包,我们一般是

source("http://bioconductor.org/biocLite.R") ##安装BiocInstaller

options(BioC_mirror=”http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/“) 如果需要切换镜像

biocLite("ggbio")

或者直接BiocInstaller::biocLite('ggbio') ## 前提是你已经安装好了BiocInstaller

某些时候你还需要卸载remove.packages("BiocInstaller") 然后安装新的

如果是3.5和以上的版本,需要使用BiocManager

install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("KEGG.db",ask=F,update=F)

备注:起初是下载R包无法联网,所以失败,根据我们的经验当然是options(download.file.method = ‘libcurl’

  • 1
    点赞
  • 1
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值