ggplot2箱式图两两比较_第十九章_使用ggplot2进行高级绘图

• 介绍ggplot2包
• 使用形状、颜色和尺寸来对多元数据进行可视化
• 用刻面图比较各组
• 自定义ggplot2图

19.1 R中的四种图形系统

• 基础
• grid
• lattice
• ggplot2(用的较多)
  • gghub

需要的R包

• ggpolt2
• gridExtra(可以拼图)
• car

19.2 ggplot2介绍

library(ggplot2)ggplot(data=mtcars, aes(x=wt, y=mpg)) +geom_point() +labs(, x="Weight", y="Miles Per Gallon")

image-20200719172844715

ggplot()初始化图形并且指顶要用到的数据来源(mtcars)和变量(wt\mpg)。aes()函数的功能是指定每个变量扮演的角色(aes代表aesthetics，即如何用视觉形式呈现信息)。

• 变量wt的值映射到沿x轴的距离，变量mpg的值映射到沿y轴的距离。
• ggplot()函数设置图形但没有自己的视觉输出。使用一个或多个几何函数向图中添加了几何对象(简写为geom)，包括点、线、条、箱线图和阴影区域。
• geom_point()函数在图形中画点，创建了一个散点图。labs()函数是可选的，可添加注释(包括轴标签和标题)。

library(ggplot2)ggplot(data=mtcars, aes(x=wt, y=mpg)) +geom_point(pch=17, color="blue", size=2) +geom_smooth(method="lm", color="red", linetype=2) +labs(, x="Weight", y="Miles Per Gallon")

汽车重量与汽油里程的散点图，它们的最佳拟合线及其95%的置信区间

• 选用geom_point()函数来设置点的形状为三角形(pch=17)，点的大小加倍(size=2)，并使颜色为蓝色(color="blue")。
• geom_smooth()函数增加了一条“平滑”曲线。这里需要线性拟合(method="lm")，并且产生一条红色(color="red")虚线(linetype=2)，线条尺寸为1(size=1)。
• 默认情况下，平滑的曲线包括在95%的置信区间(较暗带)内。

ggplot2包提供了分组和小面化的方法，分组是再一个图形中显示两组或多组观察结果，小面化是指再单独并排的图形上显示观察组。ggplot2再定义组和面时使用因子(factor)

示例：

我们可以使用mtcars数据集来查看分组和面。首先，将am、vs和cyl变量转化为因子：

rm(list=ls())mtcars$am labels=c("Automatic", "Manual"))mtcars$vs labels=c("V-Engine", "Straight Engine"))mtcars$cyl #绘图library(ggplot2)ggplot(data=mtcars, aes(x=hp, y=mpg,shape=cyl, color=cyl)) +geom_point(size=3)+facet_grid(am~vs)+labs(,      x="Horsepower", y="Miles Per Gallon")

包含变速箱类型(自动对手动)和发动机装置(V型发动机与直列式发动 机)每个组合的分离的散点图。每个点的颜色和形状表示该汽车发动机汽缸的数量。在本例中，am和vs是刻面变量，cyl是分组变量。

19.3 用几何函数指定图的类型

函数	添加	选项
geom_bar()	条形图	color、fill、alpha
geom_boxplot()	箱线图	color、fill、alpha、notch、width
geom_density()	密度图	color、fill、alpha、linetype
geom_histogram()	直方图	color、fill、alpha、linetype、binwidth