centos7 r语言安装_R语言小白入门第一步,视频手把手教你如何安装R包

1167ce14b9ae9b7ed9b864a99ea708f8.gif点击【医学方】  关注我们 f627b06ae5bd34a2bb92ff2ec08980ea.png

各位医学方的朋友,大家好。我是Flyman,今天和大家分享一下R包安装的各种姿势。谈到R包,大家都会觉得没有R包的R语言,可能就不那么吸引人了,根据最新的Rdocument网站显示,目前仅CRAN的包就达到了19557个,足以见的其魅力无穷呀。

731efad1982077bb6dc0108bd85a630d.png 今天,我们主要是带着大家总结一下R包安装的各种方法。

视频版:

文 字版:

1

鼠标点击安装,首先选择Tools,然后选择install packages,如下:

7525c11eedb5a0df704db8437adde60a.png

点开之后,如下:

f9d1d69c718e2af01ef2081b7b4feb32.png

这个时候你只需要在你的箭头所指的地方输入R包的名字即可。

2

代码安装即所谓的命令行安装。 这里需要简单的区分一下CRAN和Bioconda上的工具包,如果是CRAN,则是使用install.packages,如果是Bioconda则是可以通过BioMange::install来实现安装。 首先我们看一下CRAN上的包,比如我们安装用于生存分析的survival包:

命令如下:

a67d0110010961152f79bfbc78392324.png 通过加载判断我们是否成功的安装上了这个工具包,即library一下即可(注意: 弹出的warning信息不用去管) 5575e3bf066dfa1581f4456d7b9d556b.png 这个过程其实看起来很简单,只需要填充所需要的包的名字即可,实际上,install.packages的内置参数很多。 比如我们要安装指定版本的工具包,首选我们看一下自己安装的这个包的版本号,采用packageVersion命令如下: b51c1174c16770e00b9f10ecdfd8d242.png 可以看到我们安装的版本号为3.1.12

那如果我们想安装3.1.08版本,如下:

https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/survival/

链接是CRAN发布的survival的版本:

3b15b7c849d120be82cb24d76d5460c6.png 右键选择复制链接地址,即代表这个包的url地址:

f041b8c88944e11a0bf67ae6cd9ae7a1.png

7c5c99c128e25ede8874d99b8557df72.png

接着用install.packages(packageurl,type=‘source’),注意设置type为source,这样就可以成功安装自己指定的版本了。

3

Bionconda上如何安装呢?

类比CRAN,Bioconda上也可以安装指定版本的包,首先我们学一下如何在Bioconda上安装一个工具包,比如我们安装一个差异分析的limma包,我们采用命令行安装:

8a21add51abc8e4525852d4072012d09.png

很明显这里我们没有设置版本号,默认安装的是最新版本。

e65af86666f9611860552752e434c2f3.png 可以看到我们安装的是3.42.2版本。

如果我们想安装一个低版本的limma,该怎么做呢?同样可以采用install.packages,如下:

Limma链接:

https://bioconductor.org/packages/3.10/bioc/src/contrib/Archive/limma/

65f52b7a970d39a575dbe5614141bda1.png

这个时候我们查看一下版本号:

e538f35d2fb494eadfd5175abb6cd415.png 那么看到这个,恭喜你成功安装了你想要版本的R包 53551fc762bd74b72d60ae2587378682.png Ok,今天的推文就到这,我们给大家详细介绍了如何安装R包,安装CRAN还是Bioconda都给大家做了介绍。 当然了,我们之前也推出了R语言课程,带着大家从入门到精通,欢迎大家持续关注,最后,欢迎大家留言,有不正确的地方,也请大家留言指正。 2f363ad6468a8a2b3947656424b67556.png 4c2939125010767c77a0bb3392c4aecb.png征 稿 启 事

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