我正在研究python和bio序列。
我有序列。在seq1 = \
... """ atgaaatttatcattgaacgtgagcatctgctaaaaccactgcaacaggtcagtagcccg
... ctgggtggacgccctacgttgcctattttgggtaacttgttgctgcaagtcacggaaggc
... tctttgcggctgaccggtaccgacttggagatggagatggtggcttgtgttgccttgtct
... cagtcccatgagccgggtgctaccacagtacccgcacggaagttttttgatatctggcgt
... ggtttacccgaaggggcggaaattacggtagcgttggatggtgatcgcctgctagtgcgc
... tctggtcgcagccgtttctcgctgtctaccttgcctgcgattgacttccctaatctggat
... gactggcagagtgaggttgaattcactttaccgcaggctacgttaaagcgtctgattgag
... tccactcagttttcgatggcccatcaggatgtccgttattatttgaacggcatgctgttt
... gagaccgaaggcgaagagttacgtactgtggcgaccgatgggcatcgcttggctgtatgc
... tcaatgcctattggccagacgttaccctcacattcggtgatcgtgccgcgtaaaggtgtg
... atggagctggttcggttgctggatggtggtgatacccccttgcggctgcaaattggcagt
... aataatattcgtgctcatgtgggcgattttattttcacatctaagctggttgatggccgt
... ttcccggattatcgccgcgtattgccgaagaatcctgataaaatgctggaagccggttgc
... gatttactgaaacaggcattttcgcgtgcggcaattctgtcaaatgagaagttccgtggt
... gttcggctctatgtcagccacaatcaactcaaaatcactgctaataatcctgaacaggaa
... gaagcagaagagatcctcgatgttagctacgaggggacagaaatggagatcggtttcaac
... gtcagctatgtgcttgatgtgctaaatgcactgaagtgcgaagatgtgcgcctgttattg
... actgactctgtatccagtgtgcagattgaagacagcgccagccaagctgcagcctatgtc
... gtcatgccaatgcgtttgtag"""
seq2 = \
... """ accgtagcatctgctaaaaccagtacgcccg
... ctgggtggacgatgcaacttgttgctgcaagtcacggaaggc
... tctttgcggctgaccggtaccgacttggagatggagatggtggcttgtgttgccttgtct
... cagtcccatgagccgggtgctaccacagtacccgcacggaagttttttgatatctggcgt
... ggtttacccgaaggggcggaaattacggtagcgttggatggtgcatgatcgcctgctagtgcgc
... tctggtcgcagccgtttctcgctgtctaccttgcctgcgattgacttccctaatctggat
... gactggcagagtgaggttgaattcactttaccgcaggctacgttaaagcgtctgattgag
... tccactcagttttcgatgctatttatgtccgttattatttgaacggcatgctgttt
... gagaccgaaggcgaagagttacgtactgtggcgaccgatgggcatcgcttggctgtatgc
... tcaatgcctattggccaggctaattcggtgatcgtgccgcgtaaaggtgtg
... atggagctggttcggttgctggatggtggtgatacccccggcccctgcaaattggcagt
... aataatattcgtgctcatgtgggcgattttattttcacatctaagctggttgatggccgt
... ttcccggattatcgccgcgtattgccgaagaatcctgataaaatgctggaagccggttgc
... gtcatgccaatgcgtttgtag"""
我想知道seq1和seq2中有多少字符串是相同的,以及它们各自的位置。
这不仅是模式匹配,而且还获得位置。
有谁能告诉我如何使用python实现同样的功能?在