python模式字符串_使用python进行字符串模式匹配

我正在研究python和bio序列。

我有序列。在seq1 = \

... """ atgaaatttatcattgaacgtgagcatctgctaaaaccactgcaacaggtcagtagcccg

... ctgggtggacgccctacgttgcctattttgggtaacttgttgctgcaagtcacggaaggc

... tctttgcggctgaccggtaccgacttggagatggagatggtggcttgtgttgccttgtct

... cagtcccatgagccgggtgctaccacagtacccgcacggaagttttttgatatctggcgt

... ggtttacccgaaggggcggaaattacggtagcgttggatggtgatcgcctgctagtgcgc

... tctggtcgcagccgtttctcgctgtctaccttgcctgcgattgacttccctaatctggat

... gactggcagagtgaggttgaattcactttaccgcaggctacgttaaagcgtctgattgag

... tccactcagttttcgatggcccatcaggatgtccgttattatttgaacggcatgctgttt

... gagaccgaaggcgaagagttacgtactgtggcgaccgatgggcatcgcttggctgtatgc

... tcaatgcctattggccagacgttaccctcacattcggtgatcgtgccgcgtaaaggtgtg

... atggagctggttcggttgctggatggtggtgatacccccttgcggctgcaaattggcagt

... aataatattcgtgctcatgtgggcgattttattttcacatctaagctggttgatggccgt

... ttcccggattatcgccgcgtattgccgaagaatcctgataaaatgctggaagccggttgc

... gatttactgaaacaggcattttcgcgtgcggcaattctgtcaaatgagaagttccgtggt

... gttcggctctatgtcagccacaatcaactcaaaatcactgctaataatcctgaacaggaa

... gaagcagaagagatcctcgatgttagctacgaggggacagaaatggagatcggtttcaac

... gtcagctatgtgcttgatgtgctaaatgcactgaagtgcgaagatgtgcgcctgttattg

... actgactctgtatccagtgtgcagattgaagacagcgccagccaagctgcagcctatgtc

... gtcatgccaatgcgtttgtag"""

seq2 = \

... """ accgtagcatctgctaaaaccagtacgcccg

... ctgggtggacgatgcaacttgttgctgcaagtcacggaaggc

... tctttgcggctgaccggtaccgacttggagatggagatggtggcttgtgttgccttgtct

... cagtcccatgagccgggtgctaccacagtacccgcacggaagttttttgatatctggcgt

... ggtttacccgaaggggcggaaattacggtagcgttggatggtgcatgatcgcctgctagtgcgc

... tctggtcgcagccgtttctcgctgtctaccttgcctgcgattgacttccctaatctggat

... gactggcagagtgaggttgaattcactttaccgcaggctacgttaaagcgtctgattgag

... tccactcagttttcgatgctatttatgtccgttattatttgaacggcatgctgttt

... gagaccgaaggcgaagagttacgtactgtggcgaccgatgggcatcgcttggctgtatgc

... tcaatgcctattggccaggctaattcggtgatcgtgccgcgtaaaggtgtg

... atggagctggttcggttgctggatggtggtgatacccccggcccctgcaaattggcagt

... aataatattcgtgctcatgtgggcgattttattttcacatctaagctggttgatggccgt

... ttcccggattatcgccgcgtattgccgaagaatcctgataaaatgctggaagccggttgc

... gtcatgccaatgcgtttgtag"""

我想知道seq1和seq2中有多少字符串是相同的,以及它们各自的位置。

这不仅是模式匹配,而且还获得位置。

有谁能告诉我如何使用python实现同样的功能?在

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