Linux单机运行vasp,VASP单机编译

[转]VASP程序的编译标 题: VASP程序的编译

转 大话西游站 (Tue Jul 6 21:19:59 2004)

下面以编译VASP4.4.5版本为例,编译更新的版本VASP4.5.5、VASP4.6和VASP5.0(即将发布)的步骤与此相同。

1、 所需文件和程序

VASP源代码:vasp.4.4.5.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz

数学库:LAPACK和BLAS (),

或mkl(配合intel的fotran编译器用),

或ATLAS ()

或Lib GOTO ()

Fortran编译器:PGI fortran 至少4.0以上版本(),

或Intel的 ifc (8.0以上版本是ifort, ),前者可以从网站上下载到15天的试用版本,后者可以从网站下载到免费的版本。

2、下面采用PGI fortan编译器pgf90、ATLAS数学库对VASP4.4.5进行编译

这里假定已经安装好了fortran编译器,所有文件都放在/home/xxx/VASP_SRC目录下,机器的操作系统是Linux: Redhat9.0。

A) 从下载atlas3.6.0_Linux_P4SSE2.tar.gz,并用如下命令解压:tar xzvf atlas3.6.0_Linux_P4SSE2.tar.gz

解压后得到一个目录Linux_P4SSE2,在此目录下有个lib子目录,该lib子目录中的文件为libatlas.a, libcblas.a, libf77blas.a, liblapack.a, 这些就是编译vasp时所需要的数学库文件之一。

B) 用如下命令解压vasp.4.4.5.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz:

tar xzvf vasp.4.4.5.tar.gz

tar xzvf vasp.4.lib.tar.gz

解压后分别得到目录vasp.4.4和vasp.4.lib,目录vasp.4.4中文件是vasp的主要源代码,vasp.4.lib是编译vasp时需要的一些特定的数学库程序,在这两个目录中都有编译时所用的makefile文件,针对机器和fortran编译器,选择相应的makefile。

C) 进入vasp.4.lib目录,选择makefile.linux_pg,并把它拷贝成makefile,然后键入make命令开始编译。整个命令如下:

cd vasp.4.lib

cp makefile.linux_pg makefile

make

编译成功后,得到libdmy.a文件。

D) 退出vasp.4.lib目录,进入vasp.4.4目录,选择makefile.linux_pg,并把它拷贝成makefile,编辑makefile文件,通过修改LIB变量的赋值而采用基于ATLAS的数学库文件,修改的地方和方法是:

把makefile 中的以$开头的ATLATS 下面的路径设置成你自己的ATLAS路径

修改后保存makefile文件,键入make命令开始编译vasp。整个命令为:

cd ..

Cd vasp.4.4

cp makefile.linux_pg makefile

编辑修改makefile文件

make

编译成功后,就可以得到VASP的可执行文件vasp。

E) 以root帐号登录机器,把成功编译VASP后得到的vasp放到/bin目录下,则任何一个普通用户都可以使用vasp。此时vasp可以当成于一个linux的命令来使用了,不再需要把vasp拷贝到当前的计算目录下。

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