mysql性能探针_用R和mysql把基因对应的最大表达量探针挑出来

懂点芯片数据分析的都应该知道，芯片设计的时候，对一个基因设计了多个探针，这样设计是为了更好的捕获某些难以发现的基因，或者重点研究某些基因。

但是对我们的差异分析不方便，所以我们只分析哪些有对应了entrez ID的探针，而且对每个entrez ID，我们只需要挑选它表达量最高的那个探针。

所以就演化为一个编程问题：分组求最大值，多公共列合并！

如果是在R语言里面，那么首先这个table的表示形式如下

> esetDataTable[1:10,c(7,8)]

EGID rowMeans

1000_at 5595 1840.04259751826

1001_at 7075 799.075414422572

1002_f_at 1557 50.4884096416177

1003_s_at 643 142.372008051308

1004_at 643 211.65300963049

1005_at 1843 4281.29318032004

1006_at 4319 38.5784289213085

1007_s_at NA 1489.98158531843

1008_f_at 5610 4013.576753977

1009_at 3094 3070.50648167305

我们首先看看一个R语言函数处理方式吧，这个是比较容易想到的算法，但是用到了循环，非常的不经济，计算量很大。