plot()是R中为对象作图的一个泛型函数(它的输出将根据所绘制对象类型的不同而变化);plot(x,y,type="b")表示将x置于横轴,y置于纵轴,绘制点集(x,y),然后使用线段将其连接;type="b"表示同时绘制点和线,使用help(plot)可以查看其它选项。
实例:
> dev.new() # 打开一个新的图形窗口
NULL
> dose<-c(20,30,40,45,60)
> drugA<-c(16,20,27,40,60)
> drugB<-c(15,18,25,31,40)
> plot(dose,drugA,type="b") #绘制药物A剂量和响应的折线图
修改符号和线条
> opar<-par(no.readonly = TRUE) # 生成一个可以修改的当前图形参数列表
> par(lty=2,pch=17) # 将线条类型修改为虚线(lty=2),将点符改为实心三角(pch=17)
> plot(dose,drugA,type="b") # 绘制图形
> par(opar) # 还原原始设置
> plot(dose,drugA,type = "b",lty=2,pch=17) # 也可实现上述修改
> plot(dose,drugA,type = "b",lty=2,pch=15,lwd=3,cex=2) # 也可实现上述修改
pch= 指定绘制点时使用的符号,可能的值如下图所示。
cex= 指定符号的大小。cex是一个数值,表示绘图符号相对于默认大小的缩放倍数。默认大小为1。1.5表示放大为默认值的1.5倍,0.5表示缩小为默认值的50%,等等。
lty= 指定线条类型,可能的值如下图所示。
lwd= 指定线条宽度。lwd是以默认值的相对大小来表示的(默认值为1)。例如,lwd=2将生成一条两倍于默认宽度的线条。
修改颜色
用于指定颜色的参数
col= 默认的绘图颜色。某些函数(如lines和pie)可以接受一个含有颜色值的向量并自动循环使用。例如,设定col=c("res","blue")并需要绘制三条线,则第一条线将为红色,第二条为蓝色,第三条又将为红色
col.axis= 坐标刻度文字的颜色
col.lab= 坐标轴标签(名称)的颜色
col.main= 标题颜色
col.sub= 副标题颜色
fg= 图形的前景色
bg= 图形的背景色
> plot(dose,drugA,type = "b",lty=2,pch=19,lwd=2,cex=1,col="red")
> plot(dose,drugB,type = "b",lty=6,pch=23,lwd=2,cex=1.5,col="blue",bg="green")
修改图形尺寸和边界大小
用于控制图形尺寸和边界大小的参数
pin=c(宽,高) 以英寸表示图形的尺寸(宽和高)
mai=c(下,左,上,右) 以数值向量表示边界的大小,顺序为“下、左、上、右”,单位为英寸
mar= c(下,左,上,右) 以数值向量表示边界的大小,顺序为“下、左、上、右”,单位为英分,默认值为c(5,4,4,2)+0.1
实例:
> opar<-par(no.readonly = TRUE)
> par(pin=c(2,3)) # 宽2英寸,高3英寸
> par(cex.axis=0.75,font.axis=3) # 坐标轴刻度文字缩小至默认值的0.75倍,使用斜体字样
> par(lwd=2,cex=1.5) # 线条宽度两倍于默认宽度,符号放大为默认值的1.5倍
> plot(dose,drugB,type = "b",lty=6,pch=23,col="blue",bg="green") # 绘制图形
> par(opar) # 还原原始设置
添加文本、自定义坐标轴和图例
绘制药物A剂量和响应的折线图,符号(pch)用矩形表示、填充(bg)绿色,线型(lty)设为虚线红色(col)、宽度(lwd)为2,图像尺寸(pin)为4*3,边界(mai)上下为0.5英寸、左右为1英寸,添加标题(main)、副标题(sub)、坐标轴标签(xlab、ylab)并指定坐标轴范围(xlim,ylim)
plot(dose,drugA,type = "b",col="blue",lty=3,lwd=2,pch=22,cex=1,bg="green",pin=c(4,3),mai=c(0.5,1,0.5,1,0.5),main="Clinical Trials for Drug A",sub="This is hypothetical data",xlab="Dosage",ylab="Drug Response", xlim=c(0,60),ylim=c(0,70))
注:某些高级绘图函数已经包含了默认的标题和标签,可以通过在plot()语句或者单独的par()语句中添加ann=FALSE来移除它们
另外,也可以使用title()函数为图形添加标题和坐标轴标签,使用函数axis()来创建自定义的坐标轴,其格式分别为
title(main=“标题”,sub=“副标题”,xlab=“x轴标签”,ylab=“y轴标签”)
axis(side,at=,labels=,pos=,lty=,col=,las=,tck=,...)
side 是一个整数,表示在图形的哪边绘制坐标轴(1=下,2=左,3=上,4=右)
at 是一个数值型向量,表示要绘制刻度线的位置
labels 是一个字符型向量,表示置于刻度线旁边的文字标签(如果为NULL,则直接使用at中的值)
pos 坐标轴线绘制位置的坐标(即与另一条坐标轴相交的位置的值)
lty 线条类型
col 线条和刻度线颜色
las 标签是否平行于(=0),或者垂直于(=2)坐标轴
tck 刻度线的长度,以相对于绘图区域大小的分数表示(负值表示在图形外侧,正直表示在图形内侧,0表示禁用刻度,1表示绘制网格线);默认值为-0.01
注:创建自定义坐标轴时应该禁用高级绘图函数自动生成的坐标轴,使用参数axes=FALSE禁用全部坐标轴(包括坐标轴框架线,除非添加了参数frame.plot=TRUE),参数xaxt=“n”和yaxt=“n”分别禁用X轴和Y轴(会留下框架线,只是去除了刻度)
实例:
> dev.new() # 打开一个新的图形窗口
NULL
> #生成数据
> x<-c(1:10)
> y<-x
> z<-10/x
> #生成一个可以修改的当前图形参数列表、
> opar<-par(no.readonly = TRUE)
> #添加边界大小
> par(mar=c(5,4,4,8)+0.1)
> #绘制x对y的图形
> plot(x,y,type = "b",pch=21,col="red",yaxt="n",lty=3,ann = FALSE)
> #添加x对1/x的直线
> lines(x,z,type = "b",pch=22,col="blue",lty=2)
> #绘制自定义坐标轴
> axis(2,at=x,labels=x,col.axis="red",las=2)
> axis(4,at=z,labels = round(z,digits=2),col.axis="blue",las=2,cex.axis=0.7,tck=-0.01)
> #添加标题和文本
> mtext("y=1/x",side = 4,line = 3,cex.lab=1,las=2,col = "blue")
> title("An Example of Creative Axes",xlab = "X values",ylab = "Y=X")
> par(opar) # 还原原始设置