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原创 R语言入门:vegan包vegdist()函数的解释与用法
vegan包中的vegdist()函数是用于计算生态学研究中样本间距离或相异性的函数。该函数主要用于计算样本之间的距离矩阵。描述了函数的基本用法,和method的一些参数含义。
2024-04-20 11:00:00 2422 1
原创 R语言入门:“Hellinger“转化和“normalize“转化(弦转化)的公式表示与R代码实现
进行样方标准化时,可采用:"Hellinger"转化和"normalize"转化(弦转化)。文章给出了两种转化的数学公式表示,帮助对标准化过程的列,附上了代码及解释。
2024-04-19 10:57:57 2202
原创 R语言入门:vegan包diversity()、simpson.unb()、fisher.alpha()、specnumber函数
Shannon, Simpson, and Fisher diversity indices and species richness.3、参数解释3.1 diversity() 3.2 simpson.unb()3.3 fisher.alpha()代码来自于:[Package vegan version 2.6-4 Index],在Rstudio中可找到这个代码。这里对生态数据集BCI进行了一系列生物多样性分析,并进行了一些统计计算和绘图,以了解不同栖息地之间的物种多样性和差异。Run e
2024-04-16 16:12:01 2421
原创 R语言入门:lines()函数及其参数的初步解释
函数在同一个图形上添加了一条正弦曲线,线的颜色为红色,线型为虚线。一种通用函数,以各种方式给出坐标,并将相应的点与线段连接起来。函数用于在一个已有的图形上添加直线或曲线,通常与。函数创建了一个散点图,然后使用。这个示例中,我们首先使用。参考:Package。
2024-04-15 11:00:00 2503 1
原创 R语言入门:创建散点图矩阵pairs()函数的基本用法
这里的每个小图(对角线的四个除外),是两个变量之间的散点图,显示了两个不同变量之间的关系。通过观察这些散点图的形态,可以初步判断两个变量之间的关系是正相关、负相关还是无关。它通过在一个矩阵中展示所有可能的两两变量之间的散点图来帮助我们理解多个变量之间的相关性、趋势和异常值等信息。这里不妨查看一下使用的内置数据集“iris”,数据包括了150个样本的五个特征,最后一列是品种(3种,每种50个样本,图中未显示完全),共150行5列。函数来创建一个散点图矩阵,以探索这些特征之间的关系。参考:Package。
2024-04-15 08:00:00 1851 1
原创 R语言入门:vegan包使用decostand()函数实现标准化的几种方法(举例更新中)
该函数为群落生态学研究提供了一些流行的(和有效的)标准化方法。x: 群落数据,类似矩阵的对象,用于进行标准化处理。method: 标准化方法。MARGIN: 如果默认不可接受,则为边界。1 = 行,2 = 列。: 在中找到范围的矩阵。这允许在数据的子集之间使用相同的范围。MARGIN的维度必须与x匹配。logbase: 在中使用的对数基数。na.rm: 忽略行或列标准化中的缺失值。zap: 使接近零的值成为精确的零,以避免负值和夸张的物种丰富度估计。2、method部分:标准化方法。
2024-04-12 18:19:20 1873
原创 R语言入门:设置图形布局的函数par()
par()函数是 R 中用于设置图形参数(graphics parameters)的函数,可以控制图形的各种属性,例如绘图区域的大小、坐标轴的属性、文本的样式等。下面是par()其中是一个以逗号分隔的参数列表,用于指定图形的各种属性。mfrow:指定图形的布局,即将绘制的图形排列成多少行多少列的矩阵。mar:指定绘图区域的边距,控制绘图区域与图形边界之间的距离。oma:指定整个图形的外边距,包括主标题、副标题和图例等。cex:控制文本的相对大小。font:指定文本的字体。col。
2024-04-12 11:02:37 1973
原创 R语言入门:R的基本绘图功能(柱状图、散点图、折线图、直方图和饼图)及其参数设置汇总
包括了R中的基础图形绘制,及其参数解释,参数包括:main、col、breaks、bg、pch等等。
2024-04-12 09:50:18 5987
原创 R语言入门:summary()函数的用法
创建一个向量# 生成向量的摘要统计信息summary(x)这里显示了向量x的最小值、第一四分位数、中位数、均值、第三四分位数和最大值。2.2# 创建一个数据框ID = 1:5,# 生成数据框的摘要统计信息这里显示了数据框data的每一列的摘要统计信息,包括最小值、第一四分位数、中位数、均值、第三四分位数和最大值。第一四分位数(Q1):也称为下四分位数,它将数据集分为25%的下部分。换句话说,25%的观测值小于或等于第一四分位数。在数据的分布图上,第一四分位数标记了25%处的位置。
2024-04-11 15:18:40 4157
原创 R语言入门:unlist()函数的用法
在这些示例中,可以看到unlist()函数的使用方式和效果。它可以将复杂的嵌套结构转换为扁平的向量,方便进行数据处理和分析。
2024-04-11 14:47:37 983
原创 Zotero文献PDF批量导出小技巧
1、Ctrl+A进行一个全选(选择需要的文献即可)3、选择文件夹,等待即可,非常快滴~2、文件→导出PDFs。
2024-01-28 17:11:06 3291 2
原创 Zotero的300M不够用怎么办?一个小插件就解决啦
添加插件重启之后是可以直接使用的,因为我当时没做任何设置,文件夹是自动声称在zotero相同的目录里,比如我的zotero在D盘里,zotero云端同步也是D盘里。Zotero的免费空间只有300M,zotero管理文献实在是太香啦,我试过很多种方法,包括坚果云同步,但因为我只用电脑看文献,觉得还是麻烦了些,并且坚果云出现的响应不及时一度让我很烦恼。虽然只能同步文件条目,不能同步PDF了,但是这个插件真的很方便,我的PDF默认打开软件设置的知云翻译,就可以实现zotero整理,便捷翻译了。
2024-01-24 21:22:56 4154
原创 Zotero+知云文献翻译,好用!推荐~
知云文献翻译个人觉得翻译还是做笔记都蛮好用诶,虽然添加备注的功能都笨笨的,但是不影响使用捏。设置完以后点击zotero里面的PDF就可以直接跳转到知云打开啦。这里在zotero首选项→打开PDF时使用→选知云参考文献就好啦。一个文献翻译小技巧推荐啦~非常的简单。
2024-01-24 16:59:41 3177
原创 学习打卡:Python函数,定义函数、传递信息、传递实参的两种方式及注意事项
4.3 注意:如果函数里面只指定了一个实参,而函数定义时有两个形参,Python默认把那一个实参当做位置实参,因此这里的默认值形参放在了最后。那么调用函数仅仅给taste指定实参,就会报错,因为Python会当做那个实参是给species的,而taste没有指定~3.1 位置实参:基于实参的位置进行关联,实参的顺序指向形参的顺序。4.1 若给形参指定了默认值,则不给形参指定实参时,Python将使用默认值。4.2 若给形参指定了默认值,同时给形参指定实参,Python将使用实参。
2023-12-29 15:20:02 612 1
原创 Python学习打卡:while循环退出程序、列表间元素移动、删除特定值以及字典填充
5、一个填充字典的练习: 通过用户输入,收集姓名以及喜欢的地点,存为字典,检索检验。4、填充字典:使用input的键值对,填充字典。3、删除列表中的特定值:删除重复元素的值。仍然是一个门外汉记的笔记~2、 列表间移动元素。
2023-12-29 10:27:34 432 1
原创 While循环的三种退出方式:break,条件测试,flag
1、使用break退出循环,并不输出‘quit’2、条件测试退出循环,并不输出‘quit’3、flag退出循环,并不输出‘quit’这是一个门外汉记的笔记~
2023-12-28 17:05:02 1717
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