java环境测试_GSEA分析之前Java环境搭建

使用GSEA需要在Java环境下运行，所以搭建好Java运行环境应该是使用GSEA的第一步，虽然很多时候可以使用无脑搭建Java环境，安装GSEA，但是如果碰到一点问题，没有预计到，还是很头疼。所以这一篇文章就是记录一下个人GSEA运行时Java环境的搭建时遇到的问题。

1. Java下载

1.1 版本要求

image.png

进入之后，选择相应的版本就可以。需要注册，用邮箱注册一个即可。

1.2 安装

可以是无脑安装，如果需要的话，可以自己改变安装位置，这是因为后面的环境变量的改变时需要用到。

1.3 环境搭建--环境变量

进入电脑的属性

选择高级设置

进入环境变量设置

环境变量中需要注意这两个变量的设置,一个是JAVA_HOME,另一个是PATH不区分大小写。系统变量如果没有这两个变量，可以自行新建。

变量设置参数如下：

变量名：JAVA_HOME

变量值：D:\Program Files (x86)\Java\jdk1.8.0_91

根据自己的实际路径配置，上面是我自己安装时的位置。

变量名：CLASSPATH

变量值：.;%JAVA_HOME%\lib\dt.jar;%JAVA_HOME%\lib\tools.jar;

前面有个"."

变量名：Path

变量值：%JAVA_HOME%\bin;%JAVA_HOME%\jre\bin;

注意：如果使用 1.5 以上版本的 JDK，不用设置 CLASSPATH 环境变量，也可以正常编译和运行 Java 程序。

对于win10 的系统，path的变量值要分开键入。

1.4 测试是否安装成功

win + R，打开cmd

*分别键入 java， java -version， javac检测Java环境是否搭建成功。

搭建成功后，出现的应该是上图样式。

2. GSEA 下载

对于GSEA分析，可以在选择APP版本，也可以在R上分析，这里我们选择APP版本。

2.1 下载

选择符合自己电脑配置的版本下载即可。

2.2 安装

下载后得到 .jnlp文件，直接点击安装即可。

如果不能成功，那么选择“打开方式”，选择安装Java路径下的jre安装路径，选择javaws.exe即可。

就能得到GSEA运行版本

运行即可

OK，到了GSEA熟悉的界面

解决了安装问题，下一步就是分析了。