细胞生长曲线拟合matlab,绘制细胞生长曲线及细胞群体倍增时间的简化计算

本文介绍了使用MATLAB和SPSS软件对细胞生长曲线进行指数拟合,通过简化计算推算细胞群体倍增时间的方法。通过对原始数据的处理和指数模型的应用,得出较精确且简便的细胞倍增时间计算公式T d=24h/b1,该方法适用于细胞培养研究。

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绘制细胞生长曲线

及细胞群体倍增时间的简化计算

严泉剑 郭金龙 刘恩靖 范健本 刘荣光 金小明 陈 巍

(148医院,山东周村 255300)

摘要 研究一株细胞生长曲线的原始数据,寻求合适的曲线拟合模型。在Statistical Package for the social science(SPSS)软件包上用指数拟合模型对全部数据及生长期数据进行拟合,并由此推算细胞群体倍增时间(Double time,Dt)。结果:指数拟合模型对生长期内数据进行拟合所获复相关指数较高,为0. 989,Dt=24h/b1,计算相对简单。结果提示,这种拟合方法及计算方法较为简便,可信。

关键词 细胞培殖(培养) 曲线拟合 细胞群体倍增时间

分类号 Q28

目前细胞群体倍增时间(T d)的计算方法有做图法和公式法两种〔1〕,而我们基于计数法绘制细胞生长曲线所获数据,利用SPSS软件进行理论推导而得的计算方法相对简单,实用,现介绍如下。

1 材料和方法

1.1 材料 取已发表的细胞生长曲线原始数据一组。初始接种数目分均为1×104每日细胞计数原始数据如表1所示。

1.2 方法 指数函数拟合模型(Exponential)中〔2〕,Y=b0×2b1×t要比Y=b0×e b1×t更符合细胞的生物学特性,因为细胞增殖为二分裂生长。Y=b0×2b1×t在SPSS的曲线模拟功能选项中并没有此函数拟合模型,故将原始数据的自变量时间变量作一转换,即将原自变量乘以ln2即可,理论依据为Y=b0×2b1×t=b0×e b1×tln2=b0×e b1×(tln2)。依据此列变量进行曲线拟合,记录相应复相关指数及b0,b1值。

细胞倍增时间定义是在生长曲线上细胞数量增加1倍的时间,可以从曲线上换算出,细胞倍增的时间区间即为对数生长期,细胞传代,实验多在此区间进行。细胞群体倍增时间的计算方法有2种。做图法:在细胞生长曲线的对数生长期找出细胞增加一倍所需的时间,即倍增时间,公式法,按细胞倍增时间

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