用set函数啊,给个范例吧
x = 0:0.01:20;
y1 = 200*exp(-0.05*x).*sin(x);
y2 = 0.8*exp(-0.5*x).*sin(10*x);
[ax,h1,h2] = plotyy(x,y1,x,y2,'plot');
set(ax(1),'xcolor','k','ycolor','b');
set(ax(2),'xcolor','k','ycolor','r');
hh1=get(ax(1),'ylabel');
set(hh1,'string','left y-axis');
set(hh1,'color','b');
hh2=get(ax(2),'ylabel');
set(hh2,'string','right y-axis');
set(hh2,'color','r');
set(h1,'linestyle','-');
set(h1,'color','b');
set(h2,'linestyle',':');
set(h2,'color','r');
legend([h1,h2],{'y1 = 200*exp(-0.05*x).*sin(x)';'y2 = 0.8*exp(-0.5*x).*sin(10*x)'});
xlabel('zero to 20 \musec.');
title('labeling plotyy');