卡方线性趋势检验_CochranArmitage趋势检验在关联分析中的应用

Cochran-Armitage趋势检验(CAT趋势检验)是分析两个分类变量关联性的方法,尤其适用于处理2 x K的分类数据,其中K是有序变量。它探究有序变量在各组中的发生率与排序之间的线性关系,类似逻辑回归。相比于卡方检验,CAT检验在基因型关联分析等场景中能提供更高的检验效能,是卡方检验的有效补充。
摘要由CSDN通过智能技术生成

欢迎关注”生信修炼手册”!

Cochran-Armitage trend test,简称为CAT趋势检验,是由William Cochran和Peter Armitage提出的一种分析两个分类变量关联性的检验方法,和卡方检验不同的是,该方法要求其中一个分类变量必须只有两个类别,另外一个变量则是一个有序的分类变量。

简而言之,该方法适用于处理2 x K的分类数据,这里的K是一个有序变量, K最小值为3。该方法用来探究有序变量在各组中的发生率和对应的排序之间是否存在线性关系,有点类似逻辑回归。

下图所示是一个K=3的例子

29c7953e71d879f079410b1c3ac54b05.png

CAT检验构建了一个统计量T.  计算过程如下

1d499c7951acc806806ebb0694b45245.png

1bb3a5bdd43580260264e2450fcc3ea8.png

这里的t代表的是每个k的权重,是k变量的排序顺序, 也称之为k的趋势

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值