vasp计算脚本放在服务器的位置,VASP计算过程中的一些小脚本

当前目录下有若干个作业在若干文件夹中。快速查看这些作业是否都正常结束了showOUTCAR.sh

——-

#!/bin/sh

for file in `find . -type f -name “OUTCAR”`;do

echo $file

tail $file

done

——–

如果文件名下面都是类似

User time (sec):    45053.252

System time (sec):     1908.319

Elapsed time (sec):    47150.760

则是正常结束了

或者如果计算输出都保存到log文件里，用如下语句也可以

#!/bin/sh

for file in `find . -type f -name “log”`;do

echo $file

tail -1 $file

done

出现reached required accuracy – stopping…则是正常结束。

######

重命名vasp文件，拷贝INCAR文件

#!/bin/sh

for file in `find . -type f -name “*.vasp”`;do

dirname=`dirname $file`

mv $file $dirname/POSCAR;

cp INCAR $dirname/INCAR;

done

######

#将POSCAR.1移动到文件夹1中，并重命名为POSCAR

#!/bin/sh

for file in `find . -type f -name “POSCAR.*”`;

do

dirpath=`dirname $file`

dirname=`e c h o ${file##*.}`   #echo中间的空格删除，网站的原因这个命令不能正确书写。

mkdir $dirpath/$dirname

mv $file $dirpath/$dirname/POSCAR;

done

####

显示能量

#!/bin/sh

for file in `find . -type f -name “OUTCAR”`;do

dirname=`dirname $file`

echo $dirname

grep “entropy=” $file | tail -1

done