vasp计算脚本放在服务器的位置,让搬砖变得轻松——vasp提交系列任务用的脚本...

在上adv. metal课的时候就曾经遇到过这个问题，当然那个时候还是全靠手动去做nuclei move的锅，不过现在也会遇到这样的情况，就是我要提交一系列的任务，而这一系列的任务是有一定的规律的，目前从我遇到过的case来看，主要有两种

Case 1.

这种情况每个任务里面不一样的地方只有其中一个参数，参数是单一的或者多个参数之间有某种数学关系

e.g. 要做一个convergence test，提交相同cut off energy不同k-point的一系列任务，或者POSCAR里面成比例地修改键长

用改POSCAR这个case来说，需要完成两个script：

生成POSCAR的script

首先理清思路，在我们的一系列的任务中，POSCAR是一直在变的，所以在最开始的输入文件中，我们不事先提供POSCAR这个文件，而是用每个文件夹中的script去生成跟任务文件夹对应的POSCAR文件，然后运行vasp程序->得到结果->收集结果

写一个生成POSCAR的script pos.py，这里用python写了一个，用c也可以，完全看习惯

import sys

import math

a = float(sys.argv[1]) # lattice constant

fout = open('POSCAR', 'w') # make a file named as POSCAR

fout.write(

'''G_monolayer

1.0

%.10f 0.0000000000 0.0000000000

%.10f %.10f 0.0000000000

0.0000000000 0.0000000000 3.0000000000

C

2

Cartesian

0.000000000 0.000000000 2.171259403

1.233863017 0.712369702 2.171259403

'''%(a, -a/2, math.sqrt(3)*a/2))

# construct a primitive cell with constant c direction but variable a b directions

fout.close()

这里我们是为了改变一个graphene的primitive cell的lattice