python实现排队论模型_使用python+sklearn实现物种分布模型

对物种的地理分布进行建模是保护生物学(conservation biology)中的一个重要研究课题。在本示例中，我们根据过去的观察和14个环境变量，对两种南美哺乳动物的地理分布进行了建模。由于我们只有正例(positive examples)(没有不成功的观察结果)，我们将这个问题转化为密度估计问题，并使用sklearn.svm.OneClassSVM作为建模工具。数据集由Phillips等人(2006年)提供，并使用basemap来绘制南美洲的海岸线和国界。

这两个物种是：

• “Bradypus variegatus” , the Brown-throated Sloth.

• “Microryzomys minutus” , also known as the Forest Small Rice Rat, a rodent that lives in Peru, Colombia, Ecuador, Peru, and Venezuela.

参考文献

• “Maximum entropy modeling of species geographic distributions” S. J. Phillips, R. P. Anderson, R. E. Schapire - Ecological Modelling, 190:231-259, 2006.

sphx_glr_plot_species_distribution_modeling_001

输出：

________________________________________________________________________________
Modeling distribution of species 'bradypus variegatus'
 - fit OneClassSVM ... done.
 - plot coastlines from coverage
 - predict species distribution
 Area under the ROC curve : 0.868443
________________________________________________________________________________
Modeling distribution of species 'microryzomys minutus'
 - fit OneClassSVM ... done.
 - plot coastlines from coverage
 - predict species distribution
 Area under the ROC curve : 0.993919
time elapsed: 5.01s