3D Slicer中文教程(四)—图像分割

本文是3D Slicer的图像分割教程,介绍了如何利用Segment Editor模块进行数据获取、分割工具的操作,如阈值分割。Segment Editor提供了类似Photoshop的界面,支持在三维数据上进行编辑,包括添加、移除segment,以及各种编辑效果,如阈值、平滑和布尔运算等。

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1.数据获取

(1)下载3D Slicer自带的样本数据

(2)选择自由的数据

(3)网上数据库等其他方式下载数据

2.分割工具

Segment Editor是一个用于分割的模块。细分(也称为轮廓)描绘感兴趣的结构。一些工具模仿像Photoshop或者gimp这样的绘画界面,但是可以在三维数组体素上而不是二维像素上工作。改进module_editor模块后的新模块。编辑器包含许多相同的功能和更多新功能,包括:交替细分,2D和3D视图中的显示,每段可视化选项,3D视图编辑,通过在几个切片上插值或外插分割创建分割,以任何方向编辑切片。

面板及其使用Panels and their use

Segmentation: 选择要编辑的分割数据

(1)基本介绍

Master volume:选择待分割的数据,创建分割后第一次选择的volume用于确定分割的labelmap(分辨率,轴方向,原点)。所有编辑器效果使用volume强度(例如,阈值,级别跟踪)。可以在分割过程中随时更改volume。注意:目前,更改分割的唯一方法是创建一个新的segmentation,设置其几何,然后从另一个分割导入segment

Add segment:添加一个新的segment

Remove segment: 移除segment

Show 3D: 在3D视图显示分割结果. 这是一个切换按钮。打开表面时,用户正在分割时自动创建和更新曲面。关闭时,转换不进行,因此分割过程更快。要更改表面创建参数:转到Segmentations模块,.点击Representations位置的Closed surface 栏的update按钮,单击Binary labelmap -> Closed surface,双

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