找了很多天关于jtds连接池的连接非sqlserver默认实例的方法终于找到了，因为部署程序的时候服务器的sqlserver2008不是r2但是数据库备份的是r2还原不到里面，所以第一个办法就是升级到R2，可是有可能失败，这样我们就被动了，原来的数据库不敢动，然后我就找到了一个新的办法那就是直接装R2可是，已经有了默认的实例只能换个名字安装好后只需要把连接数据库的url增加“instance=实例名”就行，例如:jdbc:jtds:sqlserver://localhost:1433/数据库名;instance=实例名。

这样就可以解决jtds连接非默认的sqlserver实例的问题了。