基于都志辉老师MPI编程书中的第15章内容。
通信域是MPI的重要概念:MPI的通信在通信域的控制和维护下进行 → 所有MPI通信任务都直接或间接用到通信域这一参数 → 对通信域的重组和划分可以方便实现任务的划分
(1)通信域(communicator)是一个综合的通信概念。其包括上下文(context),进程组(group),虚拟处理器拓扑(topology)。其中进程组是比较重要的概念,表示通信域中所有进程的集合。一个通信域对应一个进程组。
(2)进程(process)与进程组(group)的关系。每个进程是客观上唯一的(一个进程对应一个pid号);同一个进程可以属于多个进程组(每个进程在不同进程组中有个各自的rank号);同一个进程可以属于不同的进程组,因此也可以属于不同的通信域。
(3)通信域产生的方法。根据看过的资料,大概有三种方法,先简要了解路子即可:
a. 在已有通信域基础上划分获得:MPI_Comm_split(MPI_Comm comm, int color, int key, MPI_Comm *newcomm)
b. 在已有通信域基础上复制获得:MPI_Comm_dup(MPI_Comm comm, MPI_Comm *newcomm)
c. 在已有进程组的基础上创建获得:MPI_Comm_create(MPI_Comm comm, MPI_Group group, MPI_Comm *newcomm)
(4)进程组产生的方法。进程组(group)可以当成一个集合的概念,可以通过“子、交、并、补”各种方法。所有进程组产生的方法都可以套到集合的各种运算,用到的时候现看函数就可以了。
(5)“当前进程”与“通信域产生函数”。如果在已有进程组的基础上创建新的通信域(即(3)中c方法),则newcomm有两种结果:如果调用MPI_Comm_create的当前进程在group中,则newcomm就是新产生的通信域对象;如果调用MPI_Comm_create的当前进程不在group中,则newcomm就是MPI_COMM_NULL。由于MPI是多进程编程,类似“当前进程”与“通信域产生函数”这种情况会比较频繁的出现,在设计思路上要适应并行编程这种改变。
(6)不同通信域间互不干扰。“互不干扰”严格来说并不完全正确,这里想说的意思是:同一个进程,可以属于不同的通信域;同一个进程可以同时参与不同通信域的通信,互不干扰。
下面通过一个例子来感受一下进程组和通信域在MPI多进程任务划分和处理上的应用。
代码做的事情如下:
(1)共有6个进程,在MPI_COMM_WORLD中的编号分别是{0,1,2,3,4,5}。
(2)将{1,3,5}进程形成一个新的通信域comm1;将编号为{0,2,4}的进程生成一个新的通信域comm2
(3)在comm1中执行MAX归约操作;在comm2中执行MIN归约操作;在MPI_COMM_WORLD中执行SUM归约操作
(4)显示各个通信域中归约操作的结果
具体代码如下:
1 #include "mpi.h"
2 #include <stdio.h>
3 #include <stdlib.h>
4
5 #define LEN 5
6
7 int main(int argc, char *argv[])
8 {
9 MPI_Init(&argc, &argv);
10 int world_rank, world_size;
11 MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank);
12 MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_size);
13
14 MPI_Group world_group;
15 MPI_Comm_group(MPI_COMM_WORLD, &world_group);
16
17 int n = 3;
18 const int ranks[3] = {1,3,5};
19 const int ori1[1] = {1};
20 const int ori2[1] = {0};
21 int root1, root2;
22
23 // 从world_group进程组中构造出来两个进程组
24 MPI_Group group1, group2;
25 MPI_Group_incl(world_group, n, ranks, &group1);
26 MPI_Group_excl(world_group, n, ranks, &group2);
27 // 根据group1 group2分别构造两个通信域
28 MPI_Comm comm1, comm2;
29 MPI_Comm_create(MPI_COMM_WORLD, group1, &comm1);
30 MPI_Comm_create(MPI_COMM_WORLD, group2, &comm2);
31
32 // 维护发送缓冲区和接受缓冲区
33 int i;
34 double *sbuf, *rbuf1, *rbuf2, *rbuf3;
35 sbuf = malloc(LEN*sizeof(double));
36 rbuf1 = malloc(LEN*sizeof(double));
37 rbuf2 = malloc(LEN*sizeof(double));
38 rbuf3 = malloc(LEN*sizeof(double));
39 srand(world_rank*100);
40 for(i=0; i<LEN; i++) sbuf[i] = (1.0*rand()) / RAND_MAX;
41 fprintf(stderr,"rank %d:\t", world_rank);
42 for(i=0; i<LEN; i++) fprintf(stderr,"%f\t",sbuf[i]);
43 fprintf(stderr,"\n");
44 MPI_Group_translate_ranks(world_group, 1, ori1, group1, &root1);
45 MPI_Group_translate_ranks(world_group, 1, ori2, group2, &root2);
46 // MPI_COMM_WORLD comm1 comm2分别执行不同的归约操作
47 if (MPI_COMM_NULL!=comm1) { // comm1
48 MPI_Reduce(sbuf, rbuf1, LEN, MPI_DOUBLE, MPI_MAX, root1, comm1);
49 int rank_1;
50 MPI_Comm_rank(comm1, &rank_1);
51 if (root1==rank_1) {
52 fprintf(stderr,"MAX:\t");
53 for(i=0; i<LEN; i++) fprintf(stderr,"%f\t",rbuf1[i]);
54 fprintf(stderr,"\n");
55 }
56 }
57 else if (MPI_COMM_NULL!=comm2) { // comm2
58 MPI_Reduce(sbuf, rbuf2, LEN, MPI_DOUBLE, MPI_MIN, root2, comm2);
59 int rank_2;
60 MPI_Comm_rank(comm2, &rank_2);
61 if (root2==rank_2) {
62 fprintf(stderr,"MIN:\t");
63 for(i=0; i<LEN; i++) fprintf(stderr,"%f\t",rbuf2[i]);
64 fprintf(stderr,"\n");
65 }
66 }
67 MPI_Reduce(sbuf, rbuf3, LEN, MPI_DOUBLE, MPI_SUM, 0, MPI_COMM_WORLD); // MPI_COMM_WORLD
68 if (0==world_rank) {
69 fprintf(stderr,"SUM:\t");
70 for(i=0; i<LEN; i++) fprintf(stderr,"%f\t",rbuf3[i]);
71 fprintf(stderr,"\n");
72 }
73 // 清理进程组和通信域
74 if(MPI_GROUP_NULL!=group1) MPI_Group_free(&group1);
75 if(MPI_GROUP_NULL!=group2) MPI_Group_free(&group2);
76 if(MPI_COMM_NULL!=comm1) MPI_Comm_free(&comm1);
77 if(MPI_COMM_NULL!=comm2) MPI_Comm_free(&comm2);
78 MPI_Finalize();
79 }
代码执行结果如下:
可以看到:
a. MIN归约操作针对的是{0,2,4}
b. MAX归约操作针对的是{1,3,5}
c. SUM归约操作针对的是{0,1,2,3,4,5}
d. SUM与MIN或MAX归约操作在时间上可能是重叠的,参与归约操作的进程也有重叠,但在结果上没有互相干扰。
(7)组间通信域。不同的通信域之间也可以通信,核心的操作是需要构造一个新的通信域类型——组间通信域。与一般的通信域不同,组间通信域包含两个进程组:本地进程组,远程进程组。通过组间通信域可以实现上述两个不同进程组内进程之间的通信。组间通信域的创建,需要在本地组和远程组中的相关进程中都调用创建语句,而且创建语句的参数中local_leader和remote_leader还是对称的。
1 #include "mpi.h"
2 #include <stdio.h>
3 #include <stdlib.h>
4
5 int main(int argc, char *argv[])
6 {
7 MPI_Comm myComm; // 标示本地子组的组内通信域
8 MPI_Comm myFirstComm; // 组间通信域
9 MPI_Comm mySecondComm; // 组间通信域
10 int color; // split用到的key
11 int rank;
12
13 MPI_Init(&argc, &argv);
14 MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
15
16 // 划分子通信域
17 // split是如何划分的 翻阅了英文的mpi tutorial教程
18 // 通过split函数中第三个参数来控制 当前进程在新的通信域中的新rank值大小
19 color = rank % 3;
20 MPI_Comm_split(MPI_COMM_WORLD, color, rank, &myComm);
21
22 // 建立组间通信域
23 // 需要确定的问题是:
24 // 1. A1和A2构造的是01之间的通信域 A1的local leader和remote leader与A2的local leader和remote leader是不是互相对应的
25 // 2. 同理 B1和B2构造的是12之间的组间通信域 local leader和remote leader是否也是互相对应的
26 // 这是可以保证的 通过MPI_Comm_split语句中的第三个参数来保证
27 if (0==color) {
28 // 01之间的组间通信域
29 // 1. 本地组的leader是0
30 // 2. remote组的leader在MPI_COMM_WORLD中的rank是1
31 // 3. tag是1 (tag起到什么作用?)
32 // 4. 组间通信域存在myFirstComm中
33 MPI_Intercomm_create(myComm, 0, MPI_COMM_WORLD, 1, 1, &myFirstComm); // A1
34 }
35 else if (1==color) {
36 // 01之间的组间通信域
37 // 1. 本地组的leader是0 (本地组leader0应该是MPI_COMM_WORLD中的1 这是如何保证的?)
38 // 2. 同理, MPI_COMM_WORLD中的0应该是color=0那个组中rank为0的进程 这是如何保证的?
39 MPI_Intercomm_create(myComm, 0, MPI_COMM_WORLD, 0, 1, &myFirstComm); // A2
40 // 12之间的组间通信域
41 MPI_Intercomm_create(myComm, 0, MPI_COMM_WORLD, 2, 12, &mySecondComm); // B1
42 }
43 else if (2==color) {
44 // 21之间的组间通信域
45 MPI_Intercomm_create(myComm, 0, MPI_COMM_WORLD, 1, 12, &myFirstComm); // B2
46 }
47
48 if (0==color || 2==color) {
49 MPI_Comm_free(&myFirstComm);
50 }
51 else if (1==color) {
52 MPI_Comm_free(&myFirstComm);
53 MPI_Comm_free(&mySecondComm);
54 }
55 MPI_Finalize();
56 }