String Kernel SVM

String Kernel是这样一种Kernel方法，它根据两个字符串的所有公共子串计算它们的相似度，最简单的方法是用Dynamic Programming的办法，但复杂度较高，是N的平方。通过使用Suffix Tree或Suffix Array可以成功地把复杂度降为线性的，参见论文：

  Abouelhoda, M. I., Kurtz, S., & Ohlebusch, E. (2004). Replacing suffix trees with enhanced suffix arrays. Journal of Discrete Algorithms, 2, 53–86.

libSVM网站上提供的一个C语言的String Kernel源码(http://www.csie.ntu.edu.tw/~cjlin/libsvmtools/string/libsvm-2.84-string.zip)

提供String Kernel的SVM包：一个是Weka的最新版中提供了一个基于Dynamic Programming的平方复杂度的Java类包(http://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/里的Developer Verstion)，

另一个是SVMSequel软件包(http://www.cs.utah.edu/~hal/SVMsequel/)，它最大的优势之一是它提供了一种基于SuffixTree的线性复杂度的String Kernel和Tree Kernel，可惜它的下载网址打不开，另外它的全部代码由Caml语言编写。 http://www.cs.utah.edu/~hal/SVMsequel/svmsequel.tgz