Linux如何打开cp2k,centos7安装并行版cp2k6.1-POPT

centos7安装并行版cp2k6.1-POPT

centos7安装并行版cp2k6.1-POPT

一、环境介绍

系统：Centos7.6

所需软件包：cp2k-6.1.tar.bz2，libint-1.1.6.tar.gz，libxc-4.0.4.tar.gz，libxsmm-1.9.0.tar.gz

二、编译安装3个package

[[email protected] ~]$ source ~/intel/bin/compilervars.sh intel64 #加载intel环境变量

[[email protected] cp2k]$ tar xf libint-1.1.6.tar.gz #解压

[[email protected] cp2k]$ mkdir libint #创建安装目录

[[email protected] cp2k]$ cd libint-1.1.6 #进入解压目录

[[email protected] libint-1.1.6]$ ./configure --prefix=/home/zh/soft/cp2k/libint #配置环境，并指定安装目录

[[email protected] libint-1.1.6]$ make -j 4 #开始编译，-j为指定多核编译

[[email protected] libint-1.1.6]$ make install #完成编译，开始安装

[[email protected] cp2k]$ tar xf libxc-4.0.4.tar.gz #解压

[[email protected] cp2k]$ mkdir libxc #创建安装目录

[[email protected] cp2k]$ cd libxc-4.0.4 #进入解压目录

[[email protected] libxc-4.0.4]$ ./configure --prefix=/home/zh/soft/cp2k/libxc #环境配置

[[email protected] libxc-4.0.4]$ make -j 4 #开始编译，-j为指定多核编译

[[email protected] libxc-4.0.4]$ make install #完成编译，开始安装

[[email protected] cp2k]$ tar xf libxsmm-1.9.0.tar.gz #解压

[[email protected] cp2k]$ mkdir libxsmm #创建安装目录

[[email protected] cp2k]$ cd libxsmm-1.9.0/ #进入解压后的目录

[[email protected] libxsmm-1.9.0]$ make -j 4 PREFIX=/home/zh/soft/cp2k/libxsmm install #编译安装，并指定目录

三、编译安装cp2k

[[email protected] cp2k]$ tar xf cp2k-6.1.tar.bz2 #解压

[[email protected] cp2k]$ cd cp2k-6.1/arch/ #进入arch下

[[email protected] arch]$ vim Linux-x86-64-intel.popt #修改配置文件

Linux-x86-64-intel.popt文件内容

[[email protected] arch]$ cd ../makefiles/ #修改完配置文件后，进入makefiles

[[email protected] makefiles]$ make -j 8 ARCH=Linux-x86-64-intel VERSION=popt #开始编译

参数含义ARCH=Linux-x86-64-intel指定ARCH为linux系统，x86_64架构，用intel编译器

VERSION=popt指定编译mpi版本

[[email protected] makefiles]$ cd ../exe/Linux-x86-64-intel/ #编译完成，查看是否成功生成可执行程序

[[email protected] Linux-x86-64-intel]$ ls #查看文件

cp2k.popt为可执行程序

四、测试

[[email protected] cp2k-6.1]$ cd tests/MC/regtest/ #进入测试目录

[[email protected] regtest]$ mpirun -np 6 ~/soft/cp2k/cp2k-6.1/exe/Linux-x86-64-intel/cp2k.popt -i canonical.inp #运行cp2k进行计算

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