ideasvn查看自己的提交记录_NODE数据提交原始数据提交

NODE目前支持三种原始数据提交方式：HTTP，FTP和硬盘提交三种方式。用户可以在任意界面点击“SUBMIT DATA”按钮进入数据提交页面(数据提交需在登录状态下进行)。

进入数据提交系统后点击“Submit Rawdata”按钮及进入原始数据提交页面。同时，用户可以在下面的提交记录表中查看每一次提交记录。

一．HTTP方式提交原始数据

用户在HTTP提交标签页点击upload按钮，选择本地需要提交的数据，点击submit按钮既可以完成数据提交。HTTP提交方式目前仅支持100M以内大小的文件传输，因此建议例如vcf, FPKM或者RPKM表达矩阵等分析结果使用HTTP方式上传。

用户使用HTTP上传方式完成数据上传后，可以在页面的“Unarchived data”部分查看到已上传的数据。

二．FTP方式提交原始数据

对于单个文件较大的原始数据，例如测序相关的fastq文件，质谱相关的raw或者mzXML等，建议用户使用FTP方式进行数据提交。FTP上传的数据会存放在FTP临时目录，用户可以在原始数据提交也买你的“Preload datalist”表中查看上传的数据。点击“Data IntegrityCheck”按钮完成数据完整性校验后数据才会正式上传是NODE中，上传至NODE中的数据可以在 ”Unarchived data” 中查看。

NODE通过MD5和预解压两种方式对原始数据的完整性进行校验，用户上传原始数据时，需按照原始文件和对应的MD5文件成对的方式提交，例如原始文件名为sample1_1.fastq.gz则对应的MD5文件需为sample1_1.fastq.gz.md5

2.1  Windows下FTP方式提交数据

这里我们以Filezilla为例(https://filezilla-project.org/download.php?type=client)

1)运行FIleZilla，点击左上角的站点管理器

2)点击站点管理器后会进入站点菜单，在站点菜单中选择新站点，就会新建一个连接站点，然后在右侧框中填写对应的主机地址(www.biosino.org)，端口号(2121)，用户名(NODE账号)和密码(NODE密码)，将加密选项换成“要求隐式的FTP over TLS”，点击连接则可以连接到ftp。

3)将从左边拖动到右边即可完成上传，右边文件拖动到左边便可下载。

2.2  Linux下FTP方式提交数据

1)下载sslftp工具

(https://www.biosino.org/upload/download/ftpsslTool)并解压

2)cdsurgeftp_2.3f2_linux64

3)sourcesslftp.config(为了后续使用方面您也可以将sslftp命令添加到环境变量中)

4)本地命令行中输入sslftpwww.biosino.org -i -implicit_port 2121

顺序输入NODE账号和NODE登录密码

5)为本次上传创建一个子目录mkdir[new_folder]

6)进入刚刚创建的子目录cd[new_folder]

7)上传文件 put [filename]

8)可以通过ls命令查看目前目录下的文件列表

Tips: 如果您使用ls命令没有反应可能是您当前系统中的ftp不是passive模式，在第4步登录到ftp后输入passive命令即可设置为passive模式。

欢迎联系中科普瑞，协助您完成NODE数据提交工作：

电话：021- 5808 6128

邮箱：market@sinomics.com

微信：中科普瑞科研服务(微信号：sinomics)

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