MongoDB查询优化：从 10s 到 10ms

于 2017-04-28 15:52:10 发布
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文章标签： 数据库 shell 大数据
原文链接：https://yq.aliyun.com/articles/74635
版权

本文是我前同事付秋雷最近遇到到一个关于MongoDB执行计划选择的问题，非常有意思，在探索源码之后，他将整个问题搞明白并整理分享出来。付秋雷(他的博客）曾是 Tair（阿里内部用得非常广泛的KV存储系统）的核心开发成员，目前就职于蘑菇街。

背景

苏先生反馈线上某条查询很慢（10+ seconds），语句相当于

db.myColl.find({app:"my_app",requestTime:{$gte:1492502247000,$lt:1492588800000}}).sort({_id:-1}).limit(1)

myColl这个collection中的记录内容类似于：

{ "_id" : ObjectId("58fd895359cb8757d493ce60"), "app" : "my_app", "eventId" : 141761066, "requestTime" : NumberLong("1493010771753"), "scene" : "scene01" }
{ "_id" : ObjectId("58fd895359cb8757d493ce52"), "app" : "my_app", "eventId" : 141761052, "requestTime" : NumberLong("1493010771528"), "scene" : "scene02" }
{ "_id" : ObjectId("58fd895359cb8757d493ce36"), "app" : "my_app", "eventId" : 141761024, "requestTime" : NumberLong("1493010771348"), "scene" : "scene03" }
{ "_id" : ObjectId("58fd895359cb8757d493ce31"), "app" : "my_app", "eventId" : 141761019, "requestTime" : NumberLong("1493010771303"), "scene" : "scene01" }
{ "_id" : ObjectId("58fd895359cb8757d493ce2d"), "app" : "my_app", "eventId" : 141761015, "requestTime" : NumberLong("1493010771257"), "scene" : "scene01" }
{ "_id" : ObjectId("58fd895259cb8757d493ce10"), "app" : "my_app", "eventId" : 141760986, "requestTime" : NumberLong("1493010770866"), "scene" : "scene01" }
{ "_id" : ObjectId("58fd895259cb8757d493ce09"), "app" : "my_app", "eventId" : 141760979, "requestTime" : NumberLong("1493010770757"), "scene" : "scene01" }
{ "_id" : ObjectId("58fd895259cb8757d493ce02"), "app" : "my_app", "eventId" : 141760972, "requestTime" : NumberLong("1493010770614"), "scene" : "scene03" }
{ "_id" : ObjectId("58fd895259cb8757d493cdf1"), "app" : "my_app", "eventId" : 141760957, "requestTime" : NumberLong("1493010770342"), "scene" : "scene02" }
{ "_id" : ObjectId("58fd895259cb8757d493cde6"), "app" : "my_app", "eventId" : 141760946, "requestTime" : NumberLong("1493010770258"), "scene" : "scene01" }

相关的索引有：

[
    {
        "v" : 1,
        "key" : {
            "_id" : 1
        },
        "name" : "_id_",
        "ns" : "myDatabase.myColl"
    },
    {
        "v" : 1,
        "key" : {
            "responseTime" : -1
        },
        "name" : "idx_responseTime_-1",
        "ns" : "myDatabase.myColl"
    },
    {
        "v" : 1,
        "key" : {
            "app" : 1,
            "scene" : 1,
            "eventId" : -1,
            "requestTime" : -1
        },
        "name" : "idx_app_1_scene_1_eventId_-1_requestTime_-1",
        "ns" : "myDatabase.myColl"
    }
]

慢查询就是在myColl中查找符合[1492502247000, 1492588800000)这个时间范围的所有记录，以下描述中称这条查询为bad query。

如果去掉$lt:1492588800000这个约束条件，查找[1492502247000, +∞)这个时间范围，就会很快（milliseconds）。

db.myColl.find({app:"my_app",requestTime:{$gte:1492502247000}}).sort({_id:-1}).limit(1)

以下描述中称这条查询为good query。

问题来了：

  • [问题A] 这两条查询都是走的什么索引呢？导致执行时间相差如此之大
  • [问题B] 如果两条查询选取的索引不同，为什么会有这个不同呢，这两条查询长得还是挺像的
  • [问题C] 如果bad query选取和good query一样的索引，是否还会有一样的问题呢

问题A

这两条查询都是走的什么索引呢？导致执行时间相差如此之大

和Mysql一样，Mongodb也提供了explain语句，可以获取query语句的查询计划（queryPlanner）、以及执行过程中的统计信息（executionStats）。

违和发散：Cassandra中也是有类似的功能，Hbase中目前是没有看到的。

在mongo shell中的使用方法是在query语句后面加上.explain('executionStats')，对于上面的good query，对应的explain语句为：

db.myColl.find({app:"my_app",requestTime:{$gte:1492502247000}}).sort({_id:-1}).limit(1).explain('executionStats')

good query的explain语句的执行结果如下，无关细节用...省略：

{
    "queryPlanner" : {
        "plannerVersion" : 1,
        "namespace" : "myDatabase.myColl",
        "indexFilterSet" : false,
        "parsedQuery" : ...
        "winningPlan" : {
            "stage" : "LIMIT",
            "limitAmount" : 1,
            "inputStage" : {
                "stage" : "FETCH",
                "filter" : ...,
                "inputStage" : {
                    "stage" : "IXSCAN",
                    "keyPattern" : {
                        "_id" : 1
                    },
                    "indexName" : "_id_",
                    ...
                    "direction" : "backward",
                    "indexBounds" : {
                        "_id" : [
                            "[MaxKey, MinKey]"
                        ]
                    }
                }
            }
        },
        "rejectedPlans" : ...,
    },
    "executionStats" : {
        "executionSuccess" : true,
        "nReturned" : 1,
        "executionTimeMillis" : 0,
        "totalKeysExamined" : 8,
        "totalDocsExamined" : 8,
        "executionStages" : {
            "stage" : "LIMIT",
            ...
            "inputStage" : {
                "stage" : "FETCH",
                ...
                "inputStage" : {
                    "stage" : "IXSCAN",
                    ...
                    "direction" : "backward",
                    "indexBounds" : {
                        "_id" : [
                            "[MaxKey, MinKey]"
                        ]
                    },
                    "keysExamined" : 8,
                    ...
                }
            }
        }
    },
    "serverInfo" : ...,
    "ok" : 1
}

结果分为四部分：queryPlanner、executionStats、serverInfo、ok，仅关注queryPlanner、executionStats这两部分。

executionStats就是执行queryPlanner.winningPlan这个计划时的统计信息，可以从indexBounds看到good query在索引扫描（IXSCAN）阶段，使用的索引是_id主键索引。从IXSCAN这个阶段的keysExamined统计可以解释为什么good query执行的这么快，只扫描了8条数据。

同样使用explain语句看看bad query使用的是什么索引：

{
    "queryPlanner" : {
        ...
        "winningPlan" : {
            "stage" : "SORT",
            ...
            "inputStage" : {
                "stage" : "SORT_KEY_GENERATOR",
                "inputStage" : {
                    "stage" : "FETCH",
                    "inputStage" : {
                        "stage" : "IXSCAN",
                        "keyPattern" : {
                            "app" : 1,
                            "scene" : 1,
                            "eventId" : -1,
                            "requestTime" : -1
                        },
                        "indexName" : "idx_app_1_scene_1_eventId_-1_requestTime_-1",
                        ...
                        "direction" : "forward",
                        "indexBounds" : {
                            "app" : [
                                "[\"my_app\", \"my_app\"]"
                            ],
                            "scene" : [
                                "[MinKey, MaxKey]"
                            ],
                            "eventId" : [
                                "[MaxKey, MinKey]"
                            ],
                            "requestTime" : [
                                "(1492588800000.0, 1492502247000.0]"
                            ]
                        }
                    }
                }
            }
        },
        "rejectedPlans" : ...,
    },
    "executionStats" : {
        "executionSuccess" : true,
        "nReturned" : 1,
        "executionTimeMillis" : 56414,
        "totalKeysExamined" : 3124535,
        "totalDocsExamined" : 275157,
        "executionStages" : {
            "stage" : "SORT",
            ...
            "inputStage" : {
                "stage" : "SORT_KEY_GENERATOR",
                ...
                "inputStage" : {
                    "stage" : "FETCH",
                    ...
                    "inputStage" : {
                        "stage" : "IXSCAN",
                        ...
                        "direction" : "forward",
                        "indexBounds" : {
                            "app" : [
                                "[\"my_app\", \"my_app\"]"
                            ],
                            "scene" : [
                                "[MinKey, MaxKey]"
                            ],
                            "eventId" : [
                                "[MaxKey, MinKey]"
                            ],
                            "requestTime" : [
                                "(1492588800000.0, 1492502247000.0]"
                            ]
                        },
                        "keysExamined" : 3124535,
                        ...
                    }
                }
            }
        }
    },
    "serverInfo" : ...,
    "ok" : 1
}

可以看到bad query使用的索引是一个复合索引（Compound Indexes），确实和good query使用的索引不一样。同样，从IXSCAN这个阶段的keysExamined统计可以看到扫描了3124535条数据，所以执行时间会很长。

问题B

如果两条查询选取的索引不同，为什么会有这个不同呢，这两条查询长得还是挺像的

Mongodb是如何为查询选取认为合适的索引的呢？

粗略来说，会先选几个候选的查询计划，然后会为这些查询计划按照某个规则来打分，分数最高的查询计划就是合适的查询计划，这个查询计划里面使用的索引就是认为合适的索引。

好，粗略地说完了，现在细致一点说（还是那句话：没有代码的解释都是耍流氓，以下所有的代码都是基于mongodb-3.2.10）。

先看一个栈：

mongo::PlanRanker::scoreTree
mongo::PlanRanker::pickBestPlan
mongo::MultiPlanStage::pickBestPlan
mongo::PlanExecutor::pickBestPlan
mongo::PlanExecutor::make
mongo::PlanExecutor::make
mongo::getExecutor
mongo::getExecutorFind
mongo::FindCmd::explain

这是使用lldb来调试mongod时，在mongo::PlanRanker::scoreTree（代码位于src/mongo/db/query/plan_ranker.cpp）处设置断点打印出来的栈。

scoreTree里面就是计算每个查询计划的得分的：

    // We start all scores at 1.  Our "no plan selected" score is 0 and we want all plans to
    // be greater than that.
    double baseScore = 1;
    
    // How many "units of work" did the plan perform. Each call to work(...)
    // counts as one unit.
    size_t workUnits = stats->common.works;

    // How much did a plan produce?
    // Range: [0, 1]
    double productivity =
        static_cast<double>(stats->common.advanced) / static_cast<double>(workUnits);
        
    ...
        
    double tieBreakers = noFetchBonus + noSortBonus + noIxisectBonus;
    double score = baseScore + productivity + tieBreakers;

scoreTree并没有执行查询，只是根据已有的PlanStageStats* stats来进行计算。那么，是什么时候执行查询来获取查询计划的PlanStageStats* stats的呢？

在mongo::MultiPlanStage::pickBestPlan（代码位于src/mongo/db/exec/multi_plan.cpp）中，会调用workAllPlans来执行所有的查询计划，最多会调用numWorks次：

    size_t numWorks = getTrialPeriodWorks(getOpCtx(), _collection);
    size_t numResults = getTrialPeriodNumToReturn(*_query);

    // Work the plans, stopping when a plan hits EOF or returns some
    // fixed number of results.
    for (size_t ix = 0; ix < numWorks; ++ix) {
        bool moreToDo = workAllPlans(numResults, yieldPolicy);
        if (!moreToDo) {
            break;
        }
    }

问题C

如果bad query选取和good query一样的索引，是否还会有一样的问题呢

Mongodb查询时，可以借助于hint命令强制选取某一条索引来进行查询，比如上述的bad query加上.hint({_id:1})，就可以强制使用主键索引：

db.myColl.find({app:"my_app",requestTime:{$gte:1492502247000,$lt:1492588800000}}).sort({_id:-1}).limit(1).hint({_id:1})

然而，即使是这样，查询还是很慢，依然加上.explain('executionStats')看一下执行情况，解答问题A时已经对explain的结果做了些解释，所以这次着重看IXSCAN阶段的keysExamined：

{
...
        "executionStages" : {
            "stage" : "LIMIT",
            ...
            "inputStage" : {
                "stage" : "FETCH",
                "filter" : {
                    "$and" : [
                        {
                            "app" : {
                                "$eq" : "my_app"
                            }
                        },
                        {
                            "requestTime" : {
                                "$lt" : 1492588800000
                            }
                        },
                        {
                            "requestTime" : {
                                "$gte" : 1492502247000
                            }
                        }
                    ]
                },
                "nReturned" : 1,
                ...
                "inputStage" : {
                    "stage" : "IXSCAN",
                    ...
                    "nReturned" : 32862524,
                    ...
                    "keysExamined" : 32862524,
                    ...
...
}

扫描了32862524条记录，依然很慢。这个现象比较好解释了，从executionStats.executionStages可以看到，加了hint的查询经历了LIMIT => FETCH => IXSCAN 这几个阶段，IXSCAN这个阶段返回了32862524条记录，被FETCH阶段过滤只剩下一条，所以有32862523条无效扫描，为什么会有这么多无效扫描呢？

这个和业务逻辑是相关的，requestTime时间戳是随时间增长的，主键_id也可以认为随时间增长的，所以按照主键索引倒序来，最开始被扫描的是最新的记录，最新的记录是满足"requestTime" : {"$gte" : 1492502247000}这个条件的，所以good query只需要满足"app" : {"$eq" : "my_app"}就会很快返回；

然而bad query的约束条件"requestTime" : {"$gte" : 1492502247000, "$lt" : 1492588800000}中的"$lt" : 1492588800000是无法被满足的，必须要把所有比1492588800000这个时间戳新的记录都扫描完了之后才会返回。

苏先生提出了完美的解决方案：不使用_id来排序，而是使用request_time来进行排序。这样就会使用"requestTime" : -1这条索引，只需要进行"app" : {"$eq" : "my_app"}的过滤，也是milliseconds时间内完成查询。

总结

  • 搭建有效的线下调试环境是重现、解决问题的重要手段，例如之前重现zk问题时使用salt快速搭建本地集群
  • 维护开源产品不了解源码，或者没有找到看的有效入口，是很被动的，缺少定位解决问题的根本手段

参考

感谢林青大神在排查过程中提供的关键帮助。

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