我在发布之前很快搜索了这个,但找不到任何类似的帖子.如果它们存在,请告诉我.
正在执行的命令看起来非常简单.目录列表用作函数的输入.
该目录包含一堆名为“epi1_mcf_0 ###.nii.gz”的文件
命令行版本(bash在执行时运行):
fslmerge -t output_file `ls epi1_mcf_0*.nii.gz`
Shell脚本版本:
#!/bin/bash
fslmerge -t output_file `ls epi1_mcf_0*.nii.gz`
命令行版本失败,但shell脚本完美无缺.
错误消息特定于该功能,但无论如何它都包含在内.
** ERROR (nifti_image_read): failed to find header file for 'epi1_mcf_0000.nii.gz'
** ERROR: nifti_image_open(epi1_mcf_0000.nii.gz): bad header info
Error: failed to open file epi1_mcf_0000.nii.gz
Cannot open volume epi1_mcf_0000.nii.gz for reading!
我对这个问题感到非常沮丧(在我发现有一种方法可以使命令工作之后,我不太感到沮丧).
任何帮助,将不胜感激.
(或者是普遍认为应该在“fslmerge”函数中查找问题?)
解决方法:
(我先在评论中提到了这一点,但是我会做出答案,因为它有所帮助!)
你有定义的shell别名吗? (类型别名)这些将影响在命令行键入的命令,但不会影响脚本.
Linux经常将ls定义为ls –color.这可能会影响输出,因为颜色代码通过常规输出流作为转义码发送.如果使用ls –color = auto,它将自动检测其输出是否为终端.来自man ls:
By default, color is not used to distinguish types of files. That is
equivalent to using --color=none. Using the --color option without the
optional WHEN argument is equivalent to using --color=always. With
--color=auto, color codes are output only if standard output is connected to a terminal (tty).
标签:bash,linux,shell,command-line,scripting
来源: https://codeday.me/bug/20190723/1517557.html