Iris_bysshqx17的博客

原创 CMYK四色改单色

准备：psd文件步骤：视图-校样设置-工作中的CMYK图像-模式-CMYK模式合并除需要的颜色以外的非背景图层（Ctrl+E）图像-调整-单色

原创 2021-09-14

PS文字在CMYK模式下单黑案例记录1.工具：PS；2.问题图层，黑色字部分用C0M0Y0K100，蓝色字用C50M0Y0K80，白色字用C0M0Y0K0；3.设置完所有文字图层的颜色后，把颜色图层转化为形状（方法是：选中文字—文字—转换为形状），这样等下保存出来的PDF文件就是矢量字了；4.条码文件先用PS单独打开，在图像—模式中选择CMYK颜色，然后再编辑—转换为配置文件，用拾色器检查是否条码颜色为单黑，若不是，用魔棒工具直接选择黑色部分调成单黑C0M0Y0K100；5.存储为PDF文件时，

原创 EEG电极以及数字对应

原创 EEGLAB数据处理学习

matlab2016b, eeglab v2019.0比较泛：EEGLAB数据分析：预处理与后续处理官方文档：EEGLAB turorial其中的预处理部分：Single subject data processing tutorial基于 Matlab 的脑电信号处理，δ波、θ波、α波、β波这篇文章写得超棒：针对Matlab脑电数据EEG处理、 eeglab工具箱、Neuracle...

原创 Eprime与EEG的接口

写在最前不要焦虑，不要弃疗，写好程序之后要去实际的机器上调试！背景EEG脑电信号记录的是一段时间内连续的信号，而我们需要某个特定时间段内的脑电信号，而不是全部的信号。为了实现这一目标，我们需要mark，也就是在连续的脑电信号上打上一个标记。从而让数据分析的人知道需要哪一段的信息。比如说，一个Eprime实验中出现了黄色的“绿”字（mark=5）和绿色的“绿”字（mark=6），这是两种可以...

原创 eeglab安装

安装的前提：电脑中装有matlab，eeglab适用于windows，mac和ubuntu，具体可以看官网1.到EEGLAB官网下载新版的EEGLAB的zip包，解压到matlab安装文件夹中的toolbox文件夹2.因为使用的是EGI的设备，保存出来的mff格式文件（有一个.mff的文件夹）需要用eeglab的mffmatlabbio插件，所以先到EEGLAB Extensions网站下载...

原创 用Python试一下PCA和SVM

python之whl文件下载地址：https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/Python教程之RUNOOK：https://www.runoob.com/python3/python3-data-type.htmlPython教程之廖雪峰大神：https://www.liaoxuefeng.com/wiki/1016959663602400环境w...

原创 GRETNA使用流程

准备首先，我是从GRETNA的Github官网上下载的GRETNA-master这个版本。其次，安装的方法就是解压，然后把解压的文件夹添加到matlab的路径中，注意路径不要有中文，特殊符号或者空格。第三，我没有使用GRETNA来做数据的预处理。作为参考我的预处理是通过SPM12和DPARSF来完成的。最后使用的文件夹FunImgARWSDCF中每个被试一个文件夹，一个文件夹中一个Filte...

原创 预计的数据分析流程以及一些问题

1.数据预处理（到smooth）SPM12 （去掉前10层，时间层校正，头动校正，功能像结构像对齐，结构像分割，Normalise到标准空间，Smooth）2.数据预处理之detrend和filter，回归掉CSF和WM的协变量，然后用Scrubbing去头动伪迹，24PF去头动伪迹GRETNA（大概需要整理一下文件夹的结构，所以这个软件需要的文件夹结构是怎样？）或者DPARSF或者...

原创 FSL预处理功能像数据

简介FSL和AFNI以及SPM一样，是一款常用的神经影像数据处理软件。目前FSL已经出到6.0版本，我们可以通过FSL的官网来学习如何安装和使用FSL。这里是官方的安装指导页面。要注意的是，FSL的安装是基于Python2的，并且FSL需要运行在Linux系统上。使用windows的用户可以通过虚拟机，双系统或者像我一样在移动硬盘上装一个Linux系统来使用FSL。关于功能磁共振图像的预处理...

原创 ICA-AROMA 使用攻略

ICA-AROMA是什么ICA-AROMA是一种用来去除静息态功能磁共振（rfMRI）和任务态功能磁共振（fMRI）中的头动噪声的工具。它是基于ICA（独立成分分析）的一种方法，但是不需要重新训练数据集。因此适合在大数据时代应用于不同的机器扫出来的不同批的核磁数据。ICA-AROMA发布的原文献是：ICA-AROMA: A robust ICA-based strategy for remo...

原创 SPM12 核磁数据预处理 傻瓜攻略

人生最痛苦的事不是没得选择，而是选择太多而不知道究竟哪个是对的。这份傻瓜攻略写给我自己，因为我真的服了自己的脑子了。咋么能这么傻呢？希望有人看到这篇文章之后可以不需要再看其它的文章就可以顺利地从头分析到尾。也希望我不要下一次分析的时候又忘了这些经验。当然，要是想知道原理之类的还是要出门左拐。SPM（Statistical Parametric Mapping）已经拥有挺久的历史了，这个软件出...

原创 Ubuntu18.04 神经影像数据处理_相关软件包安装

一开始我装了最新的Anaconda3版本，后来出现了一些问题，比如conda upgrade --all报错，还有装fsl-complete时候也出错了，各种错误累加导致我把这个版本的Anaconda3卸掉了，然后重新装了Anaconda3-3.5.2这个版本下面的内容是默认已经安装了Anaconda3，也有了附带的Python 3.6.5然后开始安装一系列其它软件包：添加镜像源添加镜像源...

原创 .hdr/.img文件转nii.gz（利用Matlab和SPM）

步骤1：参考CSDN博主「咸鱼酱」，使用Matlab和SPM软件包将hdr/img格式的文件转成nii格式 原文链接：CSDN博主「咸鱼酱」的原创文章：https://blog.csdn.net/Lyrassongs/article/details/88544903%%img2nii.m--------------------------------------------%Script t...

原创 Ubuntu 18.04 美化

实用优先，先不弄这个，但是以后要弄的，因为界面实在不好看，所以先mark一下Ubuntu18.04美化总结输入法这个装了sougou拼音输入法，后来出现了按shift不能转换中英文的问题，已解决Chrome由于google上不去，所以这个还没有装，直接装依赖的话会导致sudo apt-get update出现问题...

原创 Ubuntu18.04中的Python和Anaconda（版本和安装）

Ubuntu18.04 自带Python3.6，没有Python2根据官方更新文档，16.04LTS版本之后的Ubuntu系统不默认安装Python3。原句为“Python 2 is no longer installed by default. Python 3 has been updated to 3.6. This is the last LTS release to include P...

原创 在移动硬盘（SDD）上装ubuntu18.04

写在最前：这篇文章还没有更新完，目前还在探索阶段从入门到放弃的数据分析不要弃疗！论一个小白如何开始一步步在移动硬盘上装ubuntu18.04中间有很多坑，很多细小的问题，在这里写出来，希望之后可以不要重蹈覆辙！总论本文的重点是在移动硬盘（SSD）上安装Ubuntu18.04 的过程。在看了很多的大佬分享的帖子之后，我发现一共是有两种途径来实现这一过程，一种是借Vmware虚拟机来实现的（...

原创 fmriprep环境配置

按照官网上的说法，fmriprep的使用有以下四种路径：OpenNeuro.orgDocker ContainerSingularity ContainerManually Prepared Environment (Python 3.5+)第一个网站打不开，遂放弃。第二和第三由于不懂Container是什么，遂放弃。于是只好选择学过皮毛的python。这一途径按照官网的说法是不推荐...

原创 功能连接图谱

Yeo的图谱，2011年发表，引用有2400+次Thomas Yeo, B. T., Krienen, F. M., Sepulcre, J., Sabuncu, M. R., Lashkari, D., Hollinshead, M., … & Fischl, B. (2011). The organization of the human cerebral cortex estima...

原创 fMRI数据处理软件一览

SPM官网：https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/AFNI官网：https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/doc/htmldoc/background_install/download_links.html#download-current-precompiled-afni-binariesFSL官网：https://fsl.fm...

原创 独立成分分析（ICA）在静息态功能连接中的应用

Pruim, R. H., Mennes, M., van Rooij, D., Llera, A., Buitelaar, J. K., & Beckmann, C. F. (2015). ICA-AROMA: A robust ICA-based strategy for removing motion artifacts from fMRI data. Neuroimage, 112...

原创 成像技术的历史和背景

本文为文末所指文献的部分原文翻译，只用于个人学习，需要使用内容请引用原文献文章是2011年的，近年来核磁技术发展迅速，一些内容已经发生变化。与酒精相关的大脑变化的第一个证据来自结构性脑成像。20世纪60年代末 70年代初，Godfrey Hounsfield因发展了颅脑电脑断层扫描（cranial computerized tomography ，CT）而被授予1979年的诺贝尔生理学或医学奖...

原创 神经影像（核磁共振）概念及数据分析学习

一、神经影像数据是什么？以前的医生检查人有没有病，可以看气色，有没有外伤，有没有鼻歪眼斜，口角流涎之类的现象，然后再把个脉，根据心跳和气运行的顺畅来判断身体哪里出现了问题。但是这些方法难以得到直观的身体内部的情况。毕竟不是人人都像尝百草的神农有一个透明的肚子。后来人们发现，通过声波或者光波透过不同物体后消减或反射回来的量的不同可以区分不同的物体。于是一些隔墙观物的影像学技术就得到了发展。而神经影...

原创 Sublime Text 3176 版本安装

软件下载地址根据操作系统版本选择对应的Sublime Text版本下载Sublime官网：https://mp.csdn.net安装方法找到下载文件位置，双击文件开始安装之后一路点击“Next”即可，有个勾选的项选择之后是将Sublime添加到鼠标右键。安装完成后，语言环境是默认的英文，不要慌，下面会介绍如何变成中文环境。安装Package ControlPackage C...