python delimiter分隔符用法_使用Python文件读写,自定义分隔符(custom delimiter)

本文介绍了如何在Python中处理自定义分隔符的文件,特别是针对fastq格式的测序结果文件。文章提供了两种解决方案:一是通过创建自定义的TextIOWrapper子类,二是使用生成器函数。同时,文章还提及了Python的IO层结构和Cython作为提高效率的选择,并分享了处理JSON文件中特殊字符的技巧。
摘要由CSDN通过智能技术生成

众所周知,python文件读取文件的时候所支持的newlines(即换行符),是指定的。这一点不管是从python的doucuments上还是在python的源码中(作者是参考了python的io版本,并没有阅读C版本),都可以看出来:

if newline is not None and not isinstance(newline, str):

raise TypeError("illegal newline type: %r" % (type(newline),))

if newline not in (None, "", "\n", "\r", "\r\n"):

raise ValueError("illegal newline value: %r" % (newline,))

好吧,问题来了,如果你恰好是个苦逼的生物狗,正在用python处理所谓的fastq格式的测序结果文件,每次只读一行往往不是你想要的。Ok, 我们也都知道其实这个问题在Perl里面十分好解决,无非就是重新定义下文件的分割符($/,The input record separator, newline by default. Set undef to read through the end of file.)

local $/; # enable "slurp" mode

local $_ = ; # whole file now here

s/\n[ \t]+/ /g;

简单粗暴有效!《Programming Perl》开头的那些关于什么是happiness定义看来所言非虚,所以你只要需要将$/定义为fastq格式的分隔符就ok了。

但是ÿ

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