python二进制比较大小的方法_比较二进制数据的最快方法?

更新:发现了三倍的加速。在这是一种在压缩位上使用numpy来节省内存的方法。要在这种格式与0s和1类型的uint8s之间进行转换,numpy提供了packbits和{}函数。在下面的代码预计算所有2^16模式的和,这些模式可以由16位的块组成。在(旧版本在数据和模板中查找字节对)我们使用视图强制转换到uint64对64位的块执行按位交集,然后再转换回uint16进行查找。在为了找到最接近的n,我们...
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更新:发现了三倍的加速。在

这是一种在压缩位上使用numpy来节省内存的方法。要在这种格式与0s和1类型的uint8s之间进行转换,numpy提供了packbits和{}函数。在

下面的代码预计算所有2^16模式的和,这些模式可以由16位的块组成。在

(旧版本在数据和模板中查找字节对)

我们使用视图强制转换到uint64对64位的块执行按位交集,然后再转换回uint16进行查找。在

为了找到最接近的n,我们使用argpartition(O(N)),而不是{}(O(N logn))。在import numpy as np

n, m = 1_000_000, 1_000

data = np.random.randint(0, 256, (n, (m + 63) // 64 * 8), dtype=np.uint8)

test = np.random.randint(0, 256, ((m + 63) // 64 * 8,), dtype=np.uint8)

def create_lookup_1d():

x, p = np.ogrid[:1<<16, :16]

p = 1 << p

return np.count_nonzero(x & p, axis=1)

lookup_1d = create_lookup_1d()

def find_closest(data, test, n):

similarities = lookup_1d[(data.view(np.uint64) & test.view(np.uint64))

.view(np.uint16)].sum(axis=1)

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