linux下运行vasp,科学网—p4vasp on Linux - 单光存的博文

p4vasp從0.2.0發展到目前的0.3.9除了可以讀POSCAR，CONTCAR以視覺化分子結構之外，更可以xml格式的vasprun.xml的輸出檔，以分析DOS，band structure等。首先介绍一下安装环境，

Linux系统：openSUSE 11.0 (x86_64)

P4vasp的安装需要的软件环境还不少。

Required packages (SuSE 8.1):

package:          version:

Required:

python             2.x.x

python-gtk         1.5.x

fltk               1.x

OpenGL:

mesasoft           4.0.3

mesaglu            4.0.3

GTK:

gtk                1.2.10

libglade           0.16

Required for compiling:

gcc

python-devel       2.2.1

mesa-devel         4.0.3

mesaglu-devel      4.0.3

mesaglut-devel     4.0.3

fltk-devel         1.1.0

swig             >=1.3.16

从p4vasp的网站上下载 http://cms.mpi.univie.ac.at/odubay/p4vasp_site/download.php?list.2

再讲讲编译过程，编译过程很简单，但是需要现把软件环境建立好。

Required的软件除了mesasoft和mesaglu都是可以用YAST直接安装的。我没有在32位的系统上试过，但是对于64位系统来说，就是用不了，网站上提供的RPM包我都试过，真的不行。所以我下面说的都是如果编译。

接着让我们看Required for compiling部分的软件，gcc采用系统自带的opensuse11带的gcc是4.3版本

python-devel、fltk-devel、swig可采用光盘中的软件包，使用YAST安装，版本分别为(2.5)、(1.18)、(1.3.35)。mesa-develmesaglu-develmesaglut-devel3个软件可以从http://www.mesa3d.org/下载，我选择的版本是7.0.4

对于mesa也有软件环境要求，dri2proto version 1.99.3 or later

Linux 2.6.28

libDRM  version 2.4.3 or later

Xorg server version 1.5 or later好在网站上有提供连接地址，安装起来也不费时。

另外还有一个软件叫pygtk也需要安装，至少需要2.0版本。没有这个P4vasp装好也不干活，

软件安装要求如下：

Requirements

============

* C compiler (GCC and MSVC supported)

* Python 2.3.5 or higher

* Glib 2.8.0 or higher

* Gtk+ 2.8.0 or higher (optional)

* libglade 2.5.0 or higher (optional)

* pycairo 0.5.0 or higher (optional)

* Numeric (optional)

optional的应该可以不用安装，不过我还是都给装上了。安装的pygtk版本为2.7.4，之所以没选择最新的版本是担心出现兼容问题。我测试过最新的2.12.1版，编译时通不过，不过也不排除是本人的问题。还有一个软件叫pygobject-2.12.3我也在编译pygtk之前安装了，但现在想不起来到底有什么用，为了保证准确记录我的安装过程，先写在这里吧。如果需要的话就到网站上下载安装。

最后就到了安装P4vasp的时候了。

0) Uninstall the old version (as root):

bash /usr/lib/p4vasp/uninstall.sh

1) unpack the file:     tar -xvzf p4vasp-x.x.x.tgz

2) change directory:    cd p4vasp-x.x.x

3) build:               make

4) install (as root):   make install

我安装的版本是v0.3.9，安装过程很顺利。没有出现问题。

但安装结束后运行p4v时没有显现程序界面，问题出在64位系统上。网上有个日志也记录了同样的问题。有兴趣可以看看。

http://wsunccake.spaces.live.com/blog/cns!AB8DB0BB93B43420!181.entry

这是SuSE 的64位版本造成的问题，p4vasp的文件都会存放在/usr/lib/python2.x/site-packages文件夹中，但由于是x86_64，所以可以把该路径下的文件全部拷贝到/usr/lib64/python2.x/site-packages下才能正常运行，要不然就无法开启。

只要把_cp4vasp.so，cp4vasp.py，p4vasp从/usr/lib/python2.x/site-packages移到/usr/lib64/python2.x/site-packages下即可。

另外，再把遇到的问题也一并记录下来。p4vasp尝试编译了3个版本，会出现cp4vasp_wrap.cpp:43952: error: invalid conversion from ‘const char*’ to ‘char*’错误，无法继续编译。原因不明。编译可以通过，但看不到程序界面。以上两个的问题可能是由于编译器版本的关系，在其他系统环境下应该可以正常编译使用。

以上就是安装的过程，希望能为尝试编译p4vasp的朋友提供些帮助。

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