怎么在linux中运行gamess,科学网—Gamess安装随心笔记（windows和Linux系统） - 李卓哲的博文...

实验室之前一直使用windows版本的Gamess，但是局限于能够使用的内核少，相比较服务器和高配置Linux系统电脑来说计算速度慢，所以身为Linux菜鸟的我在小木虫、科学网、包括百度经验和Gamess官网带的安装说明总结起来，用了几天时间终于将Linux版的Gamess安装好，并成功提交任务。在此特怀感激之情，写下这篇博文，不仅为了引用曾经帮助过我的帖子，能够让以后的Linux新手能够更快速地安装和使用Gamess，而且为了纪念自己对Linux系统的软件安装有了一点点的进步，在此，我将把windows和Linux版的Gamess安装步骤都分享给大家。

一．Windows版Gamess安装

安装前准备：win7*64系统，Gamess程序，vcredist*64和mpi*64。

1.安装vcredist*64和mpi*64。这两个程序都是免费的，在百度上一搜就可以下载，双击，选择安装路径即可，没有先后顺序。

2.安装Gamess。我这里使用的是2013-GAMESS-PGI-LINUX-Blas，双击，下一步，下一步安装即可，默认安装在C盘。

注：a.安装过程中会提示电脑重启，一定要重启。

b. Win7的Gamess提交任务没有G09那样的图形界面，必须在开始—运行—输入cmd进入DOS窗口提交任务。

二．Linux版Gamess安装

安装前准备：Linux系统，Gamess压缩包，Intel编译器(简易的安装条件)。

1.安装Intel编译器：

可以参考http://www.bkjia.com/Linuxjc/913104.html本人没有尝试过)

2.解压Gamess：

tar -xzvfgamess-current.tar.gz

3.生成配置文件，

cd gamess

./config

机器名，一般输入linux64

回车(使用默认路径)

回车(使用默认路径)

回车(gamess默认的版本号00)

Ifort(选择编译器，我这里选择的是ifort)

13(选择编译器的版本号，使用ifort-V可查)

回车

none(选择使用数学库，我这里为了避免麻烦，选择了none)

回车

sockets(选择sockets或者mpi)

no(不使用LIBCCHEM)

生成install.info和Makefile文件

4.编译ddi

cd ddi

./compddi

mv ddikick.x /home/quant/games/ddikick.x

5.编译compall

gamess文件夹下，./compall(时间很长)，完成后在gamess文件夹下产生gamess.00.x程序。

./lked gamess 00 2>&1 | tee lked.log

lked.log文件会显示过程，有The linking of GAMESS to binary gamess.00.x wassuccessful.字样说明已经连接成功。

6.建立临时文件夹

临时文件夹建在哪里都可以，要记住位置。mkdir scr (传说要建两个，但我只建了一个)

修改环境变量

vi rungms(不喜欢Ubuntu的编辑界面，所以我直接将文件拖出来编辑好拖回去的)

将下面的标红色的位置设置成自己建立临时文件夹scr的位置。运行路径GMSPATH就是gamess的安装路径。

set SCR=/home/gan/tmp/scr/

set USERSCR=/home/gan/tmp/scr/

set GMSPATH=/home/gan/games

7.测试安装是否正确。 ./runall  00  >&  runall.log  &(我直接  ./runall  00 了，这样出现问题立刻就能看到，但是输入文件将不保存。没办法，Linux的菜鸟只能这样看白话)这里是将test里的所有输入文件运行一遍，log文件全保存在gamess的安装目录中。完成后检查一下./tests/standard/checktst，显示normally就说明安装正确了。

好了，先写到这里，下次安装的时候再补充。

Linux版本安装的过程中参考了如下经验，分享下：

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