python计算spearman_python scipy: scipy.stats.spearmanr 返回 nan_python_酷徒编程知识库

我正在使用scipy stats中的spearmanr来查找许多不同样本中变量之间的相关性。 大约有2500个变量和36个样本(或观测值)

如果我使用全部36个样本计算相关性，则spearmanr效果很好，如果我仅使用前18个样本，它也可以正常工作，但是，如果我使用后18个样本，则会出错并返回nans 。

这是错误：/Home/s1215235/.local/lib/python2.7/site-packages/numpy/lib/function_base.py:1945: RuntimeWarning: invalid value encountered in true_divide

return c / sqrt(multiply.outer(d, d))

/Home/s1215235/.local/lib/python2.7/site-packages/scipy/stats/_distn_infrastructure.py:1718: RuntimeWarning: invalid value encountered in greater

cond1 = (scale > 0) & (x > self.a) & (x < self.b)

/Home/s1215235/.local/lib/python2.7/site-packages/scipy/stats/_distn_infrastructure.py:1718: RuntimeWarning: invalid value encountered in less

cond1 = (scale > 0) & (x > self.a) & (x < self.b)

/Home/s1215235/.local/lib/python2.7/site-packages/scipy/stats/_distn_infrast