(1)Analyze格式:Analyze格式储存的每组数据组包含2个文件,一个为数据文件,其扩展名为.img,包含二进制的图像资料;另外一个为头文件,扩展名为.hdr,包含图像的元数据。
(2)NIFTI格式:标准NIFTI图像的扩展名是.nii,也包含了头文件及图像资料。由于NIFTI格式和Analyze格式的关系,因此NIFTI格式也可使用独立的图像文件(.img)和头文件(.hdr)。
在fMRI的早期,Analyze格式最常用的格式,但现在逐渐被NIFTI格式所取代。Analyze格式主要不足就是头文件不能真正反映元数据。单独的.nii格式文件的优势就是可以使用标准的压缩软件(如gzip)进行压缩,而且一些分析软件包(比如FSL)可以直接读取和写入压缩的.nii文件(扩展名为.nii.gz)。
# 处理nii类型图片
from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D
from nibabel import nifti1
import nibabel as nib
from matplotlib import pylab as plt
import numpy as np
import matplotlib
# matplotlib.use('TkAgg')
# 文件名,nii或nii.gz
example_filename = './AD/AD_001/AD_001.nii'
img = nib.load(example_filename)
# 打印文件信息
print(img)
print(img.dataobj.shape)