bsub linux提交 sh,批量提交Bsub命令

1. 创建脚本如 a.sh，内容：

#!/bin/bash

for ((i=1; i<=58; i++))

do

bsub -q serial -e temp$i.err -o temp$i.log "./regex -p temp$i --m --i"

done2. 修改权限

chmod u+x a.sh3. 执行 ./a.sh

4. 得到一系列结果文件，根据结果中的某行“final size: ”进行排序，使用shell文件 b.sh，内容如下：

#!/bin/bash

for ((i=1; i<=58; i++))

do

echo -n $i " " ; grep "final size" temp$i.err

done

执行./b.sh： ./b.sh> entries

5. 接下来根据entries中的第四列进行排序：

sort -n -k 4 entries | awk "{printf $1, $4}" > sorted_entries

6. 根据排序后的文件跑程序，建立 c.sh ，内容如下：

list=(9 14 39 44 45 16 28 3 7 21 42 38 22 54 4 32 33 23 37 10 30 5 41 35

36 40 43 19 11 31 34 51 53 18 55 58 8 15 20 56 29 6 48 47 57 46 49 52 13

1 26 25 27 2 12 24 50 17)

for ((i=2; i<=58; i++))

do

printf "bsub -q serial -e ttrend_$i.err -o ttrend_$i.log \"./regex -pm $i "

for ((j=0; j

do

printf "temp%d " "${list[$j]}"

done

printf " --m --i\";"

echo

donelist是排好序的文件名。

7. 执行c.sh：./c.sh > tempbatch.sh

8. 给tempbatch.sh加上shell头 #!/bin/bash

执行tempbatch.sh，从而最终提交批处理任务。