python合并两个txt列_用一个公共列python将两个txt文件合并在一起

如何读入两个制表符分隔的文件.txt并通过一个公共列将它们映射到一起。在

例如，从这两个文件创建基因到路径的映射：

第一个文件，路径.txt在Pathway Protein

Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors P69905

Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen P69905

Metabolism P69905

Amyloids P02647

Metabolism P02647

Hemostasis P68871

第二个文件，基因.txt在

^{pr2}$

输出应该是Gene Protein Pathway

Fabp3 P11404

HBA1 P69905 Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors, Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen, Metabolism

APOA1 P02647 Amyloids, Metabolism

Hbb-b1 P02088

HBB P68871 Hemostasis

Hba P01942

如果没有与基于蛋白质id信息的基因基对应的通路，则留空。在

更新：import pandas as pd

file1= pd.read_csv("gene.csv")

file2= pd.read_csv("pathway.csv")

output = pd.concat([file1,file2]).fillna(" ")

output= output[["Gene","Protein"]+list(output.columns[1:-1])]

output.to_csv("mapping of gene to pathway.csv", index=False)

所以这只给了我一个合并的文件，这不是我所期望的。在