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每日一生信的压缩和解压缩
Genbank:AWGX01.1.gbff.gz 1.5 Mb
ASN.1:
AWGX01.1.bbs.gz 760.6 kb
提取文件时发生错误
从genebank下载的基因组的信息:
wgs.XXXX.(##.)gbff.gz Nucleotide GenBank flatfiles
wgs.XXXX.(##.)fsa_nt.gz Nucleotide FASTA files
wgs.XXXX.(##.)qscore.gz Nucleotide Quality-Score files
wgs.XXXX.(##.)gnp.gz Protein GenPept flatfiles
wgs.XXXX.(##.)fsa_aa.gz Protein
FASTA files
stats.wgs.XXXX Summary nucleotide statistics
因为WGS的文件比较大,所以也可以切割为几个部分
wgs.AAVP.1.gbff.gz
wgs.AAVP.2.gbff.gz
wgs.AAVP.1.fsa_nt.gz
wgs.AAVP.2.fsa_nt.gz
wgs.AAVP.1.gnp.gz
wgs.AAVP.2.gnp.gz
wgs.AAVP.1.fsa_aa.gz
wgs.AAVP.2.fsa_aa.gz
通过gunzip或者gzip
–d解压缩提取文件失败,在于这个文件有两次压缩,
1,在win下,可以双击这个压缩文件,然后选查看(不点解压缩,相对于第一次解压缩,注意这个时候文件大小的变化),接着点击查看或者解压缩,这就是第二次解压缩
2,在Linux下,通过gizp –d xx
xx.gz文件变为xx,然后修改xx名字为xx.gz
再次通过gizp –d
xx就得到了解压缩文件了
Linux压缩保留源文件的方法:gzip
-c filename > filename.gz Linux
解压缩保留源文件的方法:
gunzip –c filename.gz > filename
gunzip的用法1.作用
gunzip命令作用是解压文件,使用权限是所有用户。
2.格式
gunzip [-acfhlLnNqrtvV][-s
gzip作用
压缩文件
[root@www ~]# gzip
[-cdtv#] 檔名
[root@www ~]# zcat 檔名.gz
选项与参数:
-c :将压缩的数据输出到屏幕上,可透过数据流重导向来处理;
-d
:解压缩的参数;
-t :可以用来检验一个压缩文件的一致性~看看档案有无错误;
-v :可以显示出原档案/压缩文件案的压缩比等信息;
-# :压缩等级,-1 最快,但是压缩比最差、-9 最慢,但是压缩比最好!预设是 -6
gzip -d *.gz
可用于批量解压缩
范例一:将 /etc/man.config 复制到 /tmp ,并且以 gzip 压缩
[root@www ~]# cd /tmp
[root@www tmp]# cp /etc/man.config
.
[root@www tmp]# gzip -v man.config
man.config: 56.1% -- replaced with man.config.gz
[root@www tmp]# ll /etc/man.config
/tmp/man*
-rw-r--r-- 1 root root 4617
Jan 6 2007
/etc/man.config
-rw-r--r-- 1 root root 2684 Nov 10 17:24
/tmp/man.config.back.Z
-rw-r--r-- 1 root root 2057 Nov 10 17:14
/tmp/man.config.gz <==gzip压缩比较佳
[root@www tmp]# gzip -9 -c man.config >
man.config.gz
gunzip的用法
1.作用
gunzip命令作用是解压文件,使用权限是所有用户。
2.格式
gunzip [-acfhlLnNqrtvV][-s
][文件...]
或者gunzip [-acfhlLnNqrtvV][-s ][目录]
3.主要参数
-a或--ascii:使用ASCII文本模式。
-c或--stdout或--to-stdout:把解压后的文件输出到标准输出设备。
-f或-force:强行解开压缩文件,不理会文件名称或硬连接是否存在,以及该文件是否为符号连接。
-h或--help:在线帮助。
-l或--list:列出压缩文件的相关信息。
-L或--license:显示版本与版权信息。
-n或--no-name:解压缩时,若压缩文件内含有原来的文件名称及时间戳记,则将其忽略不予处理。
-N或--name:解压缩时,若压缩文件内含有原来的文件名称及时间戳记,则将其回存到解开的文件上。
-q或--quiet:不显示警告信息。
-r或--recursive:递归处理,将指定目录下的所有文件及子目录一并处理。
-S或--suffix:更改压缩字尾字符串。
-t或--test:测试压缩文件是否正确无误。
-v或--verbose:显示指令执行过程。
-V或--version:显示版本信息。
4.说明
gunzip是个使用广泛的解压缩程序,它用于解开被gzip压缩过的文件,这些压缩文件预设最后的扩展名为“.gz”。事实上,gunzip就是gzip的硬连接,因此不论是压缩或解压缩,都可通过gzip指令单独完成。
Ps:
感谢瑜哥对我这个问题的指导
一般来说,gzip就够用了,尽量不要用gunzip
参考资料:
鸟哥
http://linux.vbird.org/linux_basic/0240tarcompress.php