1、加热方式不同
微波炉进入厨房已经很多年了，它的加热原理想必大家都有所了解，是通过通电后利用内部的磁控管，将电能转化为高频率的电磁波，以一定的频率穿透食物，然后使食物的水分子进行热运动，摩擦产生热能，从而使食物加热和变熟。这样加热原理的好处是加热的时间比较短。
电蒸箱是通过水箱注水入箱体内的加热盘产生纯蒸汽对食物进行加热和烹饪，完全是通过热传递形式进行。
2、食物健康营养和口感不同
微波炉加热时的电磁波会破坏食物的营养，丧失食物里面原有的水分，让食物的口感发干、发苦；
而电蒸炉是通过热传递形式进行，不会破坏食物本身的分子结构，在密封的腔体内瞬间产生大量的蒸汽，在短时间内蒸熟食物，抑制食物营养成份流失，防止食物氧化和变味。完全能够保证食物的原汁原味，丝毫不会破坏食物本身的营养成份。
3、安全性不同
微波炉的磁控管工作时会产生辐射，不仅对食物本身有一定辐射，而且在工作时对周围的人也有辐射产生。如果微波炉的电磁外溢(由于采取了安全措施，这种外溢量很小)，会造成永远不能愈合的烧伤，微波炉能把半径3—5米的磁场结构破坏，在微波炉附近，人体细胞振荡所产生的磁场会被扰乱。所以孕妇一般不允许使用微波炉，而且一般婴儿食品也会标明禁止微波炉加热。
电蒸箱是利用本身的蒸汽微压加热煮熟食物，不存在任何光波、微波，对食物内外都没有任何辐射，而且在使用过程中，对人体也没有任何不良影响。一般技术先进的电蒸箱，技术都已经十分成熟，不但毫无辐射，而且在人性化方面做得特别好，童锁，低温门体，完全杜绝了在使用时可能产生的的各种不安全隐患。
4、对器皿的选择不同
电蒸炉可以使用任何器皿；微波炉者不能选择金属器皿，也不能用密封容器，或者一些不符合微波的某些塑料容器，不然会分解出有毒有害物质！收起
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