r语言和metawin_R语言-我们的雕琢-实用技巧和理念

r 相关技巧和备忘

r 相关技巧和备忘

R语言使用观念和小技巧当输入错误代码，命令行出现+符号，按esc结束，重新输入。

选中函数，点击F1回跳出帮助文件。

mapping=aes，注意出现类似mapping错误的时候别忘记是aes的问题。

ggplot速查表：http://rstudio.com/cheatsheets。

图形映射都有图例，也就是在aes中的变量。x,y轴可以看作的x,y的图例。

在geom中设置show.legend=F,可以去除图例。

Rsrudio在当前目录打开脚本文件，可以设置目录默认切换到当前工作目录。

千万不要设置绝对路径，保证代码的可移植性。

tab键的重要性。

尽量不去使用.R去写代码。使用proj或者Rmd。

面对键盘忘代码？快去封装小函数吧，轮子越多跑的越快。

Markdown使用

Markdown展示表格

kable函数优化R语言中的数据展示方式kable(head(tab))

表格输出：输出字符串不带引号

在输出中添加参数quote = F即可输出为不加引号的字符串。write.table(quote = F)

图形

图形：修改图例为斜体##修改图例为斜体

legend.text = element_text(size = 15,face = "italic")

修改图例为加粗斜体##修改图例为斜体

legend.text = element_text(size = 15,face = "bold.italic")

图形：修改字体# 首次需要安装win字体并导入

#install.packages("extrafont")

# library(extrafont)

loadfonts(device="win")

fonts()

####图形：保存图片#一种方式

ggsave("tax_stack_phylumpro_sample.pdf", p, width = 10, height = 6)

#另外一种

pdf("a2_PLSDA分泌物四组出图.pdf", width = 10, height = 6)

dev.off()

#第三种

tiff(file="alpha_chao1.tif", res = 300, compression = "none", width=180,height=140,units= "mm")# res = 300分辨率,units= "mm"高度和宽度的单位

dev.off()

图形 ggsave保存中文正确用法#install.packages('Cairo')

library("Cairo")

#ggsave("geo_Fus_wilt1.pdf", p1, width = 12, height =8 )

ggsave("geo_Fus_wilt.pdf", p1, width = 12, height =8 , device = cairo_pdf, family = "Song")

图形：R字体调整为新罗马字体####这种方式将所有字体调整为新罗马字体####

windowsFonts(myFont = windowsFont("Times New Roman"))

p + theme_gray(base_size = 20, base_family = "myFont")

图形：人工设定颜色

这里补充一些常见的颜色，用于绘图mi=c("#1B9E77" ,"#D95F02", "#7570B3","#E7298A")

图形：ggplot主题修改模板

注意只有theme中的才算做主图，用于保存。p =p+theme_bw()+

theme(

panel.grid.major=element_blank(),

panel.grid.minor=element_blank(),

text=element_text(family="Times New Roman",face = "bold"),

plot.title = element_text(vjust = -8.5,hjust = 0.1),

axis.title.y =element_text(size = 20,face = "bold",colour =