python dicom unet_使用U-Net进行肺结节分割案例分析:DSB3Tutorial

使用U-Net进行肺结节分割案例分析:DSB3Tutorial

本文要分析的代码作者是jonrmulholland,这里是其链接地址

数据集:LUNA 2016,这里是LUNA2016数据集详细说明链接

重要文件介绍:LUNA_mask_extraction.py,LUNA_segment_lung_ROI.py,LUNA_train_unet.py

第一步:运行LUNA_mask_extraction.py,生产images_#.npy,masks_#.npy

该步骤主要是生产掩码文件,该掩码文件作为实验的输出结果,运行成功后,可以通过下列代码查看结果:

#查看掩码生成的文件

def CheckImageMask():

working_path = "./tutorial/"

imgs = np.load(working_path + 'images_0001_0009.npy')

lungmask = np.load(working_path + 'masks_0001_0009.npy')

# np.set_printoptions(threshold=np.inf)

# print("numpy 打印显示不全处理")

# print(lungmask)

# print(imgs[0])

# print(imgs[0] * lungmask[0])

for i in range(len(imgs)):

print("image:",i)

fig, ax &

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