我一直在努力让python脚本的多个实例在SLURM上运行。在我的登录节点中,我安装了python3.6,并有一个python脚本“my_脚本.py“以文本文件作为输入读取运行参数。我可以在登录节点上使用python3.6 my_script.py input1.txt
此外,我可以提交一个脚本提交.sh要运行作业:
^{pr2}$
这运行良好,并按预期执行。但是,如果我提交以下脚本:#!/bin/bash
#
#SBATCH --job-name=hostname_sleep_sample
#SBATCH --output=output2.txt
#SBATCH --cpus-per-task=1
#
#SBATCH --mem=2G
python3.6 my_script.py input2.txt
当第一个正在运行时,我在output2.txt中收到以下错误消息:/var/spool/slurmd/job00130/slurm_script: line 9: python3.6: command not
found
当我试图以数组形式提交作业时,我发现我也有同样的问题。例如,当我用sbatch提交以下内容时:!/bin/bash
#
#SBATCH --job-name=hostname_sleep_sample
#SBATCH --output=out_%j.txt
#SBATCH --array=1-10
#SBATCH --cpus-per-task=1
#
#SBATCH --mem=2G