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原创 【生信笔记】文献原始数据下载
从SRA Run Selector下载所有样本SRR号(SRR_Acc_List.txt)。在文章中找到获取原始数据的相关描述,访问相应的数据库进行下载(如下图所示)。1)在ENA数据库搜索数据号,下载包含aspera链接的文件。这种方式下载的数据格式为.sra,需要转为.fastq。这种方式可以直接下载.fastq文件。2)简单处理链接文件并下载数据。
2024-03-05 19:41:03 421
原创 LINUX常用命令
2.切换节点模式3.清理buffers/cache4.Yum安装5.同步时间6.文件操作7.日志记录8.备份9.MD5校验10.任务管理11.快捷处理文件1)for循环2)查看文件行列数3)按某列排序4)转置5)大小写转换6)删除重复行7)删除含有关键词的行8)查找某项符合关键词的行9)取某行到最后一行10)取除了某行/列的其
2019-04-09 18:00:37 157 1
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