java 批量转utf8软件_TBTools丨科研绘图和序列分析必备软件(附使用手册...）

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十三有话说

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Q：十三，今天有啥好东西？

A：今天这款软件，绝对是科研必备，分子生物相关的，尽快下载，简直不能更牛*，序列提取，序列合并，引物检查，Blast，GO富集，KEGG分析，那些年你望而却步的图。基于JAVA的软件真的，太可怕了，功能真的没有上限。

01 软件安装

常规安装，报毒请予以信任

Finish

02 功能简介

先看看这个软件SCI 怎么看吧！

咳咳咳，都懂... 十三开始了他的表演... 多可爱的启动界面，每次启动都会献上一句鸡汤

菜单栏主要有六个小版块

1.序列处理工具：

1.1 序列提取：用于提取基因的全序列，也可以基于用户指定的染色体区间，批量提取对应的区间序列。除此之外，还有序列重命名、分列(一个Fasta序列文件中只包含一个序列)或融合(合并所有序列到一个文件)序列；

1.2 NCBI序列下载：批量下载NCBI序列；

1.3 ORF(开放阅读框)预测：与NCBI ORF finder的表现一致转录组测序后，可能想要看看某个序列时候具有完整的ORF，那么可以使用TBtools的ORF ；Prediction的“complete ORF prediction”

1.4 引物检查：检查设计的引物在自己的物种中，是否可用于扩增某个基因片段；

1.5 基因功能注释：可实现基于 GTF/GFF3(物种序列特征注释文件格式，fa，fas是基因组序列文件格式) 注释信息，从全基因组序列中提取指定特征序列集合。提取所有CDS序列集合(可用 TBtools直接翻译成蛋白序列集合)，提取所有 Exon 序列集合(即注释文件中所有转录本序列)提取所有 Gene序列集合(即基因的所有Exon和Intron序列)，提取所有 Promoter 序列集合(或为 UTR及上游1~2kb；或为 ATG及上游1~2kb等)
TBtools 也提供了 GTF/GFF3 信息整理工具，可方便用于直接整理 ID 重命名的映射文件，随后可用 Fasta Rename 直接进行批量重命名。

(Sequences Toolkit)

以下是上图子菜单下的部分截图

(Fasta Extract)

(NCBI Sequences Download)

(ORF Prediction)

(Primers Check)

(Gtf/Gff3 Sequences Extract)

2.简单易上手的Blast

(Blast) 以下是上图子菜单下的部分截图

(Two Sequences Blast) 对于Blast比对结果，TBtools支持多种可视化模式

3.GO&KEGG 这个估计大佬们都不陌生了，我就不班门弄斧了

(GO & KEGG)

(GO Enrichment)

(KEGG Enrichment) 4. 各种图处理工具 热图，火山图，PCA图，进化树等等等等

(Graphics)

(网上偷的，提升B格)

5.其他工具

看图吧，我以为我能把每个功能介绍一下，我发现这个软件真的太强大了

只要是以JAVA 为基础的软件，都有无限可能

欢迎大佬们加入十三交流群，一起交流学习

6.休闲时刻

十三还是默默的给大家介绍失传已久的俄罗斯方块和贪吃蛇吧！

啦啦啦啦，这软件是不是像极了你这个月的男朋友呢？

又帅又可爱

03 软件获取

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THE END有用请点底部的在看/转发。