大家好!今天跟大家分享的文献是2020年5月发表在Cancer Cell International(即时影响因子4.03)杂志上的一篇文献。文章基于TCGA数据库和GEO数据库中的胃癌相关数据,利用单因素Cox回归分析及LASSO算法分析确定了与胃癌预后紧密相关的4个自噬基因,构建了一个预测胃癌预后的多基因联合预测模型。
题目:Identification and validation of an individualized autophagy-clinical prognostic index in gastric cancer patients
胃癌患者个体化自噬临床预后指标的鉴定与验证
摘要
本文利用GO和KEGG分析胃癌中表达的204个自噬基因,并在Cytoscape软件中构建PPI网络,有28种差异表达的自噬基因在细胞生长,神经元死亡和细胞生长调节中富集,这些基因与铂类药物耐药,凋亡和p53信号通路有关。之后利用Cox回归分析和LASSO算法筛选了4个基因构建预后风险评分模型。根据风险评分将患者分为低风险和高风险,并进行生存分析以评估风险评分的预后预测价值,结果表明风险评分是单独可用的预后指标。生存曲线表明低风险患者的生存时间明显高于高风险患者。最后结合临床病理特征和风险评分,建立了列线图以预测个体存活率,通过外部数据GSE62254验证了列线图具有预测胃癌患者预后的能力。