什么是R语言
借用百度百科中的介绍,R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。
R是由S语言发展而来的,一套由数据操作、计算和图形展示功能整合而成的套件。
R同时支持Linux、windows和Mac OS系统,并且免费、开源、编辑方便。
R能干什么
理论上,R能够完成任何形式的数据处理、统计分析和图像可视化。
但如果用R进行数据格式的调整以及简单数据的处理确实还不如用Excel方便,同时R在统计分析中的能力也弱于专业的统计学软件。
就我个人而言,由于面对的都是组学技术得到的数据,因此R的主要用途有以下几个方面:
格式规范的大数据处理
几乎所有的数据可视化
特定的统计学分析
多个多维数据
专业软件操作繁琐
结果直接用于可视化
R的安装
R软件主体
自行搜索R项目组的主页,进入后点击页面右侧的download R链接。
会首先进入一个镜像选择页面,下滑至China部分,选择距离自己进的镜像地址,国内的用户一定要选择国内的镜像,不然下载速度会跟乌龟爬一样?
镜像选择完成后,会进入R下载页面,选择电脑操作系统对应的R安装包,下载之后正常安装即可。
RStudio
工欲善其事,必先利其器!!
如果直接使用R语言的软件界面进行工作其实相当的不方便,我们在安装完成R之后,还需要安装另一个软件工具,那就是“RStudio”。
RStudio是专门针对R语言开发的一款编辑器,可以让用户更方便的开发、管理R程序。
与R语言相同,RStudio同样支持多个操作系统,并且是免费开源的。
搜索RStudio的官网,进入页面后,在右上角点击download选项即可进入RStudio的下载页面。
下滑页面到最底部,选择电脑操作系统对应的最新版本软件安装包,下载后正常安装即可。
注1:安装RStudio之前一定要先安装好R。
注2:RStudio应该与R安装在同一个盘里,比如R安装在E盘,那么RStudio也应该安装在E盘。
RStudio操作界面
RStudio的操作界面主要为以下4个部分:
左上:R脚本的创建、编辑和储存以及数据文件的查看
左下:R命令的运行
右上:命令运行过程中所产生的数据文件
右下:图像预览、扩展包管理以及帮助文件
对于不习惯命令行操作的用户,大多在首次使用时都会遇到找不到待分析数据文件的问题,RStudio默认的工作路径在windows系统中为我的文档,需要将待分析的文件放到我的文档中,才能在RStudio界面找到目标文件。
另一种简单的方法是新建一个R运行脚本,之后将该脚本与待分析文件放于同一个本地文件夹中,使用RStudio打开该脚本,之后所有的操作及默认在该文件夹中实现。
在RStudio页面上方的Tools选项中可以打开Global Options页面,在其中可以修改RStuduio默认的运行路径和所使用的R语言版本。