给大家推荐一个进行在线GO富集分析的网站 GOrilla: http://cbl-gorilla.cs.technion.ac.il/ 可以针对几种比较常见的动植物进行GO富集分析。
1、第一步是选定物种,下拉列表中的物种涉及了以下几种:
Arabidopsis thaliana 拟南芥
Saccharomyces cerevisiae 酿酒酵母
Caenorhabditis elegans 秀丽隐杆线虫
Drosophila melanogaster 黑腹果蝇
Danio rerio (Zebrafish) 斑马鱼
Homo sapiens 人类
Mus musculus 小鼠
Rattus norvegicus 大鼠
2、第二步是选择提交单列基因还是提交两列基因:
单列基因,也就是要要进行富集分析的目标基因集,两列基因指的是除目的基因集外,还要提供背景基因集,基于第二步选择的不同,第三列需要提交的文件会有差异,前者对应一个提交框,后者对应两个提交框。
3、提交基因集:
在对应的提交框中粘贴上基因,要求格式:以Gene Symbol表示,两两之间Enter分隔,此外还可以接受gene and protein RefSeq, Uniprot, Unigene and Ensembl等表示方式。注意:可以通过提交文件非方式进行,文件格式的要求一致。如果提交