r语言进行go富集分析_GOrilla-一个在线GO富集分析的网站

本文介绍了如何利用GOrilla网站进行在线GO富集分析,涵盖多种物种如拟南芥、酿酒酵母等。用户可以提交单列或两列基因,支持多种基因标识符格式,并可以选择GO的生物学过程、分子功能或细胞组件类别进行分析。以人类为例,展示了分析过程和结果。此外,还推荐了相关生物信息学课程。
摘要由CSDN通过智能技术生成

给大家推荐一个进行在线GO富集分析的网站 GOrilla: http://cbl-gorilla.cs.technion.ac.il/   可以针对几种比较常见的动植物进行GO富集分析。

1、第一步是选定物种,下拉列表中的物种涉及了以下几种:

Arabidopsis thaliana            拟南芥

Saccharomyces cerevisiae        酿酒酵母

Caenorhabditis elegans          秀丽隐杆线虫

Drosophila melanogaster         黑腹果蝇

Danio rerio (Zebrafish)         斑马鱼

Homo sapiens                    人类

Mus musculus                    小鼠

Rattus norvegicus               大鼠

2、第二步是选择提交单列基因还是提交两列基因:

单列基因,也就是要要进行富集分析的目标基因集,两列基因指的是除目的基因集外,还要提供背景基因集,基于第二步选择的不同,第三列需要提交的文件会有差异,前者对应一个提交框,后者对应两个提交框。

3、提交基因集:

在对应的提交框中粘贴上基因,要求格式:以Gene Symbol表示,两两之间Enter分隔,此外还可以接受gene and protein RefSeq, Uniprot, Unigene and Ensembl等表示方式。注意:可以通过提交文件非方式进行,文件格式的要求一致。如果提交

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