lasso回归_R 语言 lasso回归

最新推荐文章于 2024-08-07 13:42:24 发布
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文章标签： lasso回归 r语言 回归分析 分类变量 r语言 线性回归 相关系数 r语言glmnet r语言logistic回归 r语言which
本文介绍了如何在R语言中利用lasso回归进行变量筛选，特别是在基因数据分析中的应用。通过使用glmnet包，利用交叉验证确定超参数lamda，并以线性回归为例展示具体步骤。最终，通过4折交叉验证找到最小误差对应的lamda值，并展示只剩两个变量的系数结果。
摘要由CSDN通过智能技术生成

在基因数据的分析中，经常会用到lasso(套索)这种方法来进行变量的筛选，其实就是在目标优化函数后边加一个L1正则化项，其中参数lamda为超参数，需要我们去确定。接下来以线性回归为例介绍其在R语言中的实现，当然在logistic回归、cox回归也是可用lasso的。

实例数据

data("longley")

e21df80c82ca0b650265d4b3d9e1844f.png

R包(glmnet)

library(glmnet)

我们用交叉验证来确定lamda的值，在这里我们随便指定使用nfolds=4 4折交叉验证，实际中常用5折或者10折。以Employed为因变量，其余变量为自变量(不包括年份)建立模型

set.seed(123)x <- as.matrix(longley[,-c(6,7)])cv_lasso = cv.glmnet(x, longley$Employed,nfolds = 4,family = "gaussian", alpha = 1)

在这里对应于mse最小的lamda即为我们最终采用的lamda,lambda.min就是所求，大小

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