典型相关分析_微生物多样研究—微生物深度分析概述

一、微生物深度分析方法核心思想

复杂微生物群落解构的核心思想：

不预设任何假定，客观地观测整个微生物组所发生的一系列结构性变化特征，最终识别出与疾病或所关注的表型相关的关键微生物物种、基因和代谢产物。

二、微生物深度分析方法—关联分析

进行微生物群体关联分析，需要结合两大类传统的统计分析方法：

1）无监督学习（Unsupervised learning）

2）有监督学习（Supervised learning）

无监督学习：基于对数据结构的自然分解和观察。

主要包括以下三类方法：

1）主成分分析（Principal component analysis，PCA）；

2）多维尺度分析（Multidimensional scaling， MDS）；

3）聚类分析（Clustering analysis）

有监督的学习：则是基于某种已知的样品间相互关系，尽可能地按照这种关系提取原始数据中的相关信息。

传统的有监督学习方法包括：