写在前面
我们在研究基因的时候,尤其是在研究高通量数据分析,经常会碰到我们研究的这个数据的基因ID不是我们通常意义上的基因名。拿TCGA的数据举例,TCGA RNA-seq的数据比对的基因是ID是Ensembl数据库的ID号,如果我们拿到这样的ID号的话,有一些分析是进行不下去的,所以需要转化为传统意义上的Gene Symbol。 基因ID转换的工具很多,各个数据库不同的还是在于背景数据库的问题。有时候我们拿到的基因的ID是新的ID号,但是使用的的数据库里面的数据是旧的结果就导致很多ID没办法转换为基因名。我们就介绍几个进行ID转换的工具吧! 对于ID转换的工具而言,其实操作都差不多,我们要做的其实就三步:- 提交我们要转换的ID号
- 选择这个ID号属于什么数据库
- 选择我们想要转换成什么ID号