高通写号工具_Gene ID 转换工具

写在前面

我们在研究基因的时候,尤其是在研究高通量数据分析,经常会碰到我们研究的这个数据的基因ID不是我们通常意义上的基因名。拿TCGA的数据举例,TCGA RNA-seq的数据比对的基因是ID是Ensembl数据库的ID号,如果我们拿到这样的ID号的话,有一些分析是进行不下去的,所以需要转化为传统意义上的Gene Symbol。 b2ddc1874da052130ffc92ee90043697.png 基因ID转换的工具很多,各个数据库不同的还是在于背景数据库的问题。有时候我们拿到的基因的ID是新的ID号,但是使用的的数据库里面的数据是旧的结果就导致很多ID没办法转换为基因名。我们就介绍几个进行ID转换的工具吧! 对于ID转换的工具而言,其实操作都差不多,我们要做的其实就三步:
  1. 提交我们要转换的ID号
  2. 选择这个ID号属于什么数据库
  3. 选择我们想要转换成什么ID号
DAVID DAVID(https://david.ncifcrf.gov/home.jsp),因为很多生信的文章富集分析使用的是这个数据库,所以就导致这个数据库很出名。这个数据库除了可以做富集也是可以做ID的转换的。
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