python散点图密度颜色_如何在matplotlib中用密度着色散点图?

除了@askewchan建议的hist2d或hexbin之外,您还可以使用与链接到的问题中接受的答案相同的方法。

如果你想这么做:import numpy as np

import matplotlib.pyplot as plt

from scipy.stats import gaussian_kde

# Generate fake data

x = np.random.normal(size=1000)

y = x * 3 + np.random.normal(size=1000)

# Calculate the point density

xy = np.vstack([x,y])

z = gaussian_kde(xy)(xy)

fig, ax = plt.subplots()

ax.scatter(x, y, c=z, s=100, edgecolor='')

plt.show()

jvyv1.png

如果希望按密度顺序绘制点,以便最密集的点始终位于顶部(类似于链接的示例),只需按z值对它们进行排序。我还将使用更小的标记大小,因为它看起来更好:import numpy as np

import matplotlib.pyplot as plt

from scipy.stats import gaussian_kde

# Generate fake data

x = np.random.normal(size=1000)

y = x * 3 + np.random.normal(size=1000)

# Calculate the point density

xy = np.vstack([x,y])

z = gaussian_kde(xy)(xy)

# Sort the points by density, so that the densest points are plotted last

idx = z.argsort()

x, y, z = x[idx], y[idx], z[idx]

fig, ax = plt.subplots()

ax.scatter(x, y, c=z, s=50, edgecolor='')

plt.show()

cr8aM.png

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