python define graph_利用graphtool进行图的可视化处理 | Myths的个人博客

前言

最近恶心的项目中期检查,我被分配到做社交图的分析,然而事实上我并不知道弄啥。虽然不是我自己答辩,但是考虑到还是不要太坑dalao,我决定不管怎样至少得搞点图撑撑场面免得尴尬,这几天就赶鸭子上架倒腾了下graph_tool这个专门用于对图进行可视化的python库。虽然网上中文资料不足,但是他的英文文档还是非常全面的,很多设计的小细节也在文档里提及了,非常简单容易上手。下面就从一个初学者的记录下我的学习历程。

安装

虽然是个python库,但是毕竟是要做大量数据计算的,因此graphtool在底层使用了Boost, CGAL 和 expat这几个C++库(Boost是扩展的标准库,CGAL是一个计算几何算法库,expat是一个XML解析器)。这就导致了使用通常的pip和easyinstall不太好直接安装。正确的安装姿势大概有三种:

使用Docker

源码安装

各个Linux版本的包管理器

这里主要参考graph-tool installation的各种安装说明。

从最基本的源码安装,到封装好的包管理器安装,再到最万金油的docker安装一应俱全。

看上去一片美好。

然而真正用的时候发现,如果使用docker,官方提供的镜像还是太过庞大,用起来还是太臃肿了;如果采用更新源+包管理器安装的化,要是系统的版本比较新还好,要是系统版本老了,就会报各种依赖不足的问题。。。最坑爹的是,即使采用源码安装的方式,由于开发人员比较勤快,经常更新技术,很多库都需要较新的版本,容易导致老的机器上无法编译,而且由于项目源码是托管在他自己搭的git服务器上,这个服务器还很坑,旧的版本经常下不下来。。。最近不知道为什么官网的服务器崩了,还好我之前下了源码,于是把他fork到了我的github上,做个备份。

不过还好,虽然我的服务器比较旧,但是我的台式机比较新,没啥问题。。。

函数结构

这个项目的文档非常详尽,可以参考他的quickstart,类的API在这里。下面稍微整理下大概用途,方便查找:

graph_tool

主要

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